76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0487 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  894    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  56.19 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  50 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  50.83 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  42.82 
 
 		 437 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  34.28 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  30.14 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  27.21 
 
 		 521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  30.89 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  31.13 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  24.65 
 
 		 506 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.32 
 
 		 1838 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.96 
 
 		 2807 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.59 
 
 		 1126 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  30.4 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  31.78 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.45 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  23.96 
 
 		 872 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1289 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.12 
 
 		 1019 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.8 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.06 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.57 
 
 		 828 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  28.46 
 
 		 604 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  26.12 
 
 		 4379 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1127 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.07 
 
 		 891 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.35 
 
 		 1490 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  25.98 
 
 		 3197 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  24.16 
 
 		 1275 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1210 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2553  hypothetical protein  29.47 
 
 		 319 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  21.45 
 
 		 554 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  25.9 
 
 		 3197 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  28.42 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  27.41 
 
 		 1120 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  26.82 
 
 		 974 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  25 
 
 		 494 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  29.82 
 
 		 566 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.57 
 
 		 1088 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.58 
 
 		 1009 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.63 
 
 		 2194 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.44 
 
 		 1222 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  25.62 
 
 		 1124 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  23.89 
 
 		 813 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  22.77 
 
 		 895 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  28.96 
 
 		 1127 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  24.6 
 
 		 1126 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  24.63 
 
 		 485 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  23.95 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  23.23 
 
 		 1113 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  29.19 
 
 		 663 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  28.02 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1575 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.86 
 
 		 1236 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  23.66 
 
 		 1348 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  25.57 
 
 		 803 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.32 
 
 		 1118 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.53 
 
 		 1340 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.4 
 
 		 1114 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.86 
 
 		 1557 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  25 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  22.92 
 
 		 1109 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.96 
 
 		 1113 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  23.2 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  24.41 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  23.17 
 
 		 593 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  26.67 
 
 		 1161 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.85 
 
 		 600 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.37 
 
 		 577 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  23.08 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.61 
 
 		 1189 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  23.88 
 
 		 1346 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  24.01 
 
 		 768 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.1 
 
 		 889 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  23.37 
 
 		 1129 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>