160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0385 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  100 
 
 		 974 aa  1913    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  62.04 
 
 		 1117 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  59.12 
 
 		 673 aa  309  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  55.6 
 
 		 968 aa  307  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  34.73 
 
 		 1126 aa  303  8.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  45.96 
 
 		 1189 aa  286  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  56.36 
 
 		 1083 aa  280  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  48.91 
 
 		 709 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  48.34 
 
 		 1182 aa  231  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  42.96 
 
 		 924 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  35.67 
 
 		 1490 aa  220  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  44.48 
 
 		 847 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  35.19 
 
 		 604 aa  212  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.64 
 
 		 1275 aa  194  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.18 
 
 		 1340 aa  194  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.84 
 
 		 1118 aa  182  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.32 
 
 		 1225 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.46 
 
 		 1222 aa  176  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.52 
 
 		 1113 aa  171  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.5 
 
 		 889 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.82 
 
 		 2194 aa  168  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  43.96 
 
 		 833 aa  138  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.41 
 
 		 1019 aa  137  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.34 
 
 		 891 aa  121  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.24 
 
 		 1012 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.52 
 
 		 1009 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  36.08 
 
 		 1838 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.8 
 
 		 2807 aa  116  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  34.23 
 
 		 828 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  39.48 
 
 		 472 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  34.27 
 
 		 469 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  30.87 
 
 		 1557 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  35.19 
 
 		 386 aa  106  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  32.8 
 
 		 690 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  31.47 
 
 		 616 aa  105  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.44 
 
 		 813 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  35.59 
 
 		 412 aa  101  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1289 aa  99.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  34.06 
 
 		 494 aa  95.5  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32.06 
 
 		 872 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  32 
 
 		 3193 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  34.31 
 
 		 3197 aa  92.8  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  34.38 
 
 		 1124 aa  92  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  35.38 
 
 		 3197 aa  89.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  30.43 
 
 		 485 aa  88.2  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  27.83 
 
 		 554 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  31 
 
 		 4379 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  33.22 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.09 
 
 		 1154 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  30 
 
 		 3041 aa  82.4  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  31.25 
 
 		 940 aa  82  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  27.81 
 
 		 912 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.7 
 
 		 1372 aa  79  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0386  hypothetical protein  57.89 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  30.57 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.14 
 
 		 1114 aa  73.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1638 aa  72.8  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  29.34 
 
 		 510 aa  71.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  30.87 
 
 		 657 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  30.23 
 
 		 1022 aa  70.1  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  32.82 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  27.27 
 
 		 752 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  25.91 
 
 		 917 aa  67.8  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  31.47 
 
 		 463 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1328 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.44 
 
 		 621 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 1127 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  27.04 
 
 		 749 aa  65.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  27.37 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  32.75 
 
 		 2474 aa  64.3  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  31.23 
 
 		 470 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.94 
 
 		 1088 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.68 
 
 		 959 aa  63.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 2031 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  32.22 
 
 		 1976 aa  61.2  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  27.35 
 
 		 417 aa  60.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.15 
 
 		 11716 aa  60.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1825 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1825 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  26.05 
 
 		 2031 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.8 
 
 		 803 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  27.19 
 
 		 1346 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 2031 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3626  FG-GAP repeat-containing protein  24.63 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  26.03 
 
 		 2497 aa  59.3  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  28.02 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30 
 
 		 737 aa  59.7  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  28.02 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  28.98 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1517 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.54 
 
 		 1208 aa  58.9  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  29.85 
 
 		 1029 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.44 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.86 
 
 		 2032 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  26.49 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1806 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 		 620 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  28.18 
 
 		 404 aa  56.2  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  24.84 
 
 		 3474 aa  56.2  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  23.3 
 
 		 1109 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>