111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2274 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  100 
 
 		 469 aa  945    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  60.34 
 
 		 472 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  38.79 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  39.62 
 
 		 494 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.51 
 
 		 1340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  31.36 
 
 		 1490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  39.3 
 
 		 974 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.4 
 
 		 1275 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.88 
 
 		 1118 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  35.67 
 
 		 1126 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.69 
 
 		 1113 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.35 
 
 		 889 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.29 
 
 		 2194 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.53 
 
 		 1222 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.35 
 
 		 1225 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.14 
 
 		 2807 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.43 
 
 		 1019 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.53 
 
 		 891 aa  90.9  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  29.62 
 
 		 872 aa  90.5  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.89 
 
 		 1012 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.18 
 
 		 1009 aa  86.7  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.92 
 
 		 1838 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.93 
 
 		 604 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.33 
 
 		 813 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  30.06 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  30.77 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  29.28 
 
 		 1557 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1289 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  34.53 
 
 		 828 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.57 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  30.15 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.08 
 
 		 3197 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.9 
 
 		 1193 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  32.18 
 
 		 803 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  34.48 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  30.45 
 
 		 4379 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  28.53 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  33.05 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.09 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  26.15 
 
 		 917 aa  63.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1127 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  29.32 
 
 		 577 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  27.46 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  28.21 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  30.27 
 
 		 523 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  29.12 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  37.36 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  30.83 
 
 		 1124 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  34.65 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  36.14 
 
 		 841 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.42 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  27.18 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  34.24 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.8 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.39 
 
 		 3197 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  29.47 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  29.25 
 
 		 1098 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  29 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1184 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  27.44 
 
 		 2698 aa  56.6  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1638 aa  56.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  26.23 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  29.22 
 
 		 1109 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  30.73 
 
 		 1094 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.61 
 
 		 1114 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  26.24 
 
 		 517 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  28.46 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.33 
 
 		 11716 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  28.61 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.82 
 
 		 737 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  30.04 
 
 		 1022 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  28.72 
 
 		 2474 aa  51.6  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.16 
 
 		 574 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1210 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.03 
 
 		 1236 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.13 
 
 		 1192 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  33.85 
 
 		 1208 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.1 
 
 		 585 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  27.6 
 
 		 521 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  25.22 
 
 		 524 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  29.2 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  25.3 
 
 		 583 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.25 
 
 		 1226 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  33.53 
 
 		 837 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.73 
 
 		 600 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.61 
 
 		 959 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  25.41 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  29.85 
 
 		 720 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  24.46 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  27.13 
 
 		 1126 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  27.44 
 
 		 1120 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  41.79 
 
 		 662 aa  46.6  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  28 
 
 		 829 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  25.43 
 
 		 573 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.06 
 
 		 546 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.5 
 
 		 635 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 1138 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  26.17 
 
 		 562 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  25.51 
 
 		 655 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 		 621 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>