51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0593 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  886    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  65.87 
 
 		 433 aa  571  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  55.87 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  53.49 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  47.4 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  26.12 
 
 		 521 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  30.42 
 
 		 517 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  27.7 
 
 		 523 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  32.48 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  28.57 
 
 		 524 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  30.31 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.33 
 
 		 1838 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.76 
 
 		 1126 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26 
 
 		 2807 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.32 
 
 		 616 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  26.94 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  25.41 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  28.63 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.23 
 
 		 1019 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.4 
 
 		 1275 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.38 
 
 		 1490 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  25.94 
 
 		 4379 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.7 
 
 		 872 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  26.47 
 
 		 828 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  24.83 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.44 
 
 		 600 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 		 1113 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1289 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  23.66 
 
 		 562 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.39 
 
 		 1009 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.48 
 
 		 1340 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  29.81 
 
 		 895 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  30.85 
 
 		 974 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.45 
 
 		 1114 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  26.3 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.86 
 
 		 1118 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  22.22 
 
 		 1109 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.67 
 
 		 1246 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  25.12 
 
 		 554 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.17 
 
 		 1222 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.17 
 
 		 891 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  27.12 
 
 		 1557 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  24.75 
 
 		 1337 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.34 
 
 		 1225 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  25.58 
 
 		 1346 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.52 
 
 		 635 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 		 1282 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  24.02 
 
 		 1348 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  29.07 
 
 		 663 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2553  hypothetical protein  25.28 
 
 		 319 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.09 
 
 		 889 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>