109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0727 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  100 
 
 
447 aa  883    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  30.12 
 
 
1126 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  29.23 
 
 
1275 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.09 
 
 
891 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.07 
 
 
1557 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.61 
 
 
1019 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  30.23 
 
 
828 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  30.33 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  28.61 
 
 
1124 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.97 
 
 
604 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.4 
 
 
1118 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  27.04 
 
 
872 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.8 
 
 
1490 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.59 
 
 
889 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.79 
 
 
1838 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.37 
 
 
1340 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
1127 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  26.28 
 
 
3197 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  26.74 
 
 
554 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  30.34 
 
 
657 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  29.28 
 
 
649 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.28 
 
 
472 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  29.39 
 
 
813 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  25.27 
 
 
3197 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.65 
 
 
1009 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.98 
 
 
803 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.6 
 
 
2807 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  24.68 
 
 
1289 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.61 
 
 
1193 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.47 
 
 
2194 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  27.33 
 
 
404 aa  60.1  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  29.46 
 
 
1129 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  27.33 
 
 
494 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.98 
 
 
974 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.45 
 
 
1109 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.47 
 
 
1012 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.12 
 
 
1226 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.89 
 
 
1192 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.77 
 
 
616 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 
11716 aa  57.4  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  30.95 
 
 
386 aa  57.4  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  28.44 
 
 
500 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.83 
 
 
1208 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.93 
 
 
1246 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.21 
 
 
1222 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  26.15 
 
 
4379 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  27.05 
 
 
917 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  25.66 
 
 
1337 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  27.82 
 
 
1346 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  25.44 
 
 
1348 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  23.6 
 
 
1098 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.52 
 
 
1225 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.93 
 
 
1114 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.63 
 
 
604 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.27 
 
 
1189 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  37.61 
 
 
1113 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  26.51 
 
 
593 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.46 
 
 
469 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  27.01 
 
 
506 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  27.66 
 
 
1208 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.02 
 
 
1113 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.95 
 
 
1228 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  32.26 
 
 
1022 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6354  FG-GAP repeat protein  30.77 
 
 
423 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.505611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  25.1 
 
 
1088 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  24.91 
 
 
1126 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  26.76 
 
 
1203 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  22.95 
 
 
569 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  29.81 
 
 
1166 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.62 
 
 
1170 aa  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.24 
 
 
1806 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.24 
 
 
1825 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.24 
 
 
1825 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  26.9 
 
 
2031 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.24 
 
 
2031 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.27 
 
 
1236 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  25.57 
 
 
752 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  22.26 
 
 
485 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.23 
 
 
1225 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.62 
 
 
600 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.08 
 
 
2031 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  23.04 
 
 
829 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  25.29 
 
 
1172 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  25.56 
 
 
593 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  26.95 
 
 
685 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  24.11 
 
 
1183 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3677  FG-GAP repeat-containing protein  27.22 
 
 
639 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.431632  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  26.5 
 
 
1437 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  24.04 
 
 
585 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.6 
 
 
556 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  26.8 
 
 
508 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  24.41 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  30.32 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  26.37 
 
 
1120 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  25.76 
 
 
521 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  32.76 
 
 
663 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  24.82 
 
 
524 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  39.47 
 
 
895 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.26 
 
 
551 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.83 
 
 
577 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>