287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0738 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  34.52 
 
 		 3259 aa  733    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  100 
 
 		 8871 aa  17340    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  31.39 
 
 		 16311 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  32.59 
 
 		 3132 aa  546  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  32.79 
 
 		 3229 aa  518  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  29.45 
 
 		 4661 aa  451  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  29.85 
 
 		 6678 aa  433  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  29.52 
 
 		 2567 aa  424  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  30.99 
 
 		 4285 aa  409  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  42.6 
 
 		 2807 aa  387  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  28.43 
 
 		 4854 aa  356  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.49 
 
 		 2067 aa  340  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.63 
 
 		 5020 aa  330  7e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  37.18 
 
 		 2461 aa  300  8e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  38.13 
 
 		 889 aa  254  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  37.84 
 
 		 901 aa  245  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  26.68 
 
 		 3439 aa  243  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  41.29 
 
 		 1933 aa  237  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  24.56 
 
 		 2784 aa  234  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.96 
 
 		 1553 aa  232  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  38.82 
 
 		 858 aa  230  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  43.42 
 
 		 2198 aa  228  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  34.52 
 
 		 768 aa  227  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  31.42 
 
 		 758 aa  215  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  29.08 
 
 		 1883 aa  206  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1100 aa  206  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.25 
 
 		 1963 aa  198  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  24.64 
 
 		 8321 aa  189  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  34.89 
 
 		 2467 aa  172  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  50.31 
 
 		 3391 aa  172  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  50.86 
 
 		 2132 aa  172  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  24.91 
 
 		 2887 aa  171  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  50.65 
 
 		 2853 aa  170  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  48.33 
 
 		 2820 aa  167  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.7 
 
 		 2812 aa  166  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  30.59 
 
 		 1206 aa  164  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  33.25 
 
 		 665 aa  162  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  47.59 
 
 		 1838 aa  155  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1756  FG-GAP repeat-containing protein  40.12 
 
 		 708 aa  154  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000241186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  55.1 
 
 		 2001 aa  153  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  29.45 
 
 		 2127 aa  152  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  29.55 
 
 		 6276 aa  149  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  25.82 
 
 		 3182 aa  149  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1754  FG-GAP repeat-containing protein  30.21 
 
 		 776 aa  147  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  39.5 
 
 		 492 aa  145  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  43.75 
 
 		 4465 aa  145  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  31.54 
 
 		 545 aa  144  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.72 
 
 		 3954 aa  144  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  24.77 
 
 		 3091 aa  138  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.83 
 
 		 2000 aa  138  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  42.74 
 
 		 5094 aa  138  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  42.67 
 
 		 2133 aa  137  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.3 
 
 		 2239 aa  137  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  29.09 
 
 		 3563 aa  135  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  23.98 
 
 		 2743 aa  134  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  25.65 
 
 		 3714 aa  130  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  40.4 
 
 		 1019 aa  130  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.07 
 
 		 14916 aa  130  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  25.16 
 
 		 4231 aa  125  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  44.3 
 
 		 938 aa  125  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  33.87 
 
 		 2039 aa  125  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.12 
 
 		 1599 aa  124  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  38.57 
 
 		 1855 aa  122  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  24.7 
 
 		 3699 aa  122  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  42.59 
 
 		 940 aa  122  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  27.14 
 
 		 1764 aa  121  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  31.42 
 
 		 864 aa  120  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 4334 aa  119  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.76 
 
 		 3699 aa  118  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.79 
 
 		 3363 aa  117  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  48.84 
 
 		 8980 aa  117  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  22.92 
 
 		 3758 aa  117  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.75 
 
 		 2346 aa  114  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  36.73 
 
 		 12741 aa  112  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.08 
 
 		 3427 aa  111  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  27.36 
 
 		 569 aa  110  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  34.81 
 
 		 337 aa  109  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  39.33 
 
 		 3066 aa  107  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.64 
 
 		 11716 aa  107  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  36.31 
 
 		 824 aa  107  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  34.54 
 
 		 426 aa  106  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.37 
 
 		 9867 aa  106  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  32.05 
 
 		 1037 aa  104  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  37.58 
 
 		 922 aa  104  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.51 
 
 		 3089 aa  103  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  37.12 
 
 		 1757 aa  103  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  29.57 
 
 		 429 aa  102  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  45.24 
 
 		 3041 aa  102  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1136  hypothetical protein  27.92 
 
 		 433 aa  101  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.063435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1027 aa  101  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  36.67 
 
 		 3508 aa  99.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1221  FG-GAP repeat-containing protein  35.71 
 
 		 779 aa  97.8  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000316782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  34.19 
 
 		 1022 aa  97.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  40.6 
 
 		 3193 aa  97.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  34.19 
 
 		 1017 aa  96.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.06 
 
 		 1340 aa  95.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.1 
 
 		 2555 aa  94.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  35.51 
 
 		 2839 aa  93.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.48 
 
 		 3396 aa  92.8  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.49 
 
 		 826 aa  90.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>