More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0612 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 12741 aa  24760    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  38.57 
 
 		 14829 aa  722    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  35.95 
 
 		 8980 aa  1354    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  39.82 
 
 		 15831 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.29 
 
 		 14916 aa  469  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3762  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.76 
 
 		 5342 aa  189  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0652  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1373 aa  180  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0788279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.17 
 
 		 1279 aa  151  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1154  surface protein  25.64 
 
 		 4713 aa  137  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0653  hypothetical protein  26.61 
 
 		 875 aa  135  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.442234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  41.86 
 
 		 1838 aa  132  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  28.74 
 
 		 1400 aa  130  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.33 
 
 		 4334 aa  130  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.67 
 
 		 3363 aa  124  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  35.44 
 
 		 2132 aa  119  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  35.92 
 
 		 16311 aa  119  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  34.68 
 
 		 3954 aa  118  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  29.45 
 
 		 946 aa  117  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  46.1 
 
 		 2461 aa  117  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  36.04 
 
 		 2853 aa  116  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  28.31 
 
 		 1363 aa  115  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  45.07 
 
 		 2820 aa  114  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  36.73 
 
 		 8871 aa  112  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  29.25 
 
 		 3391 aa  112  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  33.62 
 
 		 1855 aa  111  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  37.45 
 
 		 2001 aa  110  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29 
 
 		 2954 aa  111  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  40 
 
 		 2133 aa  108  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  26.79 
 
 		 824 aa  108  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  41.36 
 
 		 6678 aa  106  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  39.1 
 
 		 3132 aa  106  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  39.23 
 
 		 4465 aa  103  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  33.85 
 
 		 938 aa  103  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.14 
 
 		 1019 aa  102  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.02 
 
 		 3427 aa  102  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  34.71 
 
 		 337 aa  102  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  27.2 
 
 		 1534 aa  100  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  35.5 
 
 		 1072 aa  99.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  37.91 
 
 		 1017 aa  98.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2196  hemolysin-type calcium-binding region  24.62 
 
 		 15245 aa  97.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  42.97 
 
 		 2802 aa  97.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1047  hypothetical protein  23.92 
 
 		 6062 aa  97.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  37.25 
 
 		 1022 aa  97.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  39.44 
 
 		 3193 aa  98.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  41.46 
 
 		 940 aa  97.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4160  VCBS  27.99 
 
 		 6581 aa  96.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.530259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  32.13 
 
 		 3508 aa  96.3  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 		 1795 aa  94.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1693  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.67 
 
 		 933 aa  93.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  43.55 
 
 		 3714 aa  92.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  45.53 
 
 		 492 aa  92  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  30.27 
 
 		 965 aa  91.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0651  hypothetical protein  26.71 
 
 		 3954 aa  90.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0616  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.2 
 
 		 20646 aa  89  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  36.11 
 
 		 922 aa  89  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  25.62 
 
 		 2689 aa  88.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  36.64 
 
 		 426 aa  87.8  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  27.44 
 
 		 1532 aa  86.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  28.48 
 
 		 595 aa  84.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  29.19 
 
 		 1499 aa  83.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  32.67 
 
 		 2105 aa  82.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  27.42 
 
 		 9867 aa  83.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  31.44 
 
 		 2667 aa  82.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.32 
 
 		 795 aa  81.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2925  hypothetical protein  30.34 
 
 		 3138 aa  81.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.844856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  33.55 
 
 		 917 aa  81.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  35.42 
 
 		 2950 aa  80.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  31.18 
 
 		 820 aa  80.1  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  27.24 
 
 		 2911 aa  79  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.94 
 
 		 980 aa  78.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  34.07 
 
 		 769 aa  77.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.33 
 
 		 813 aa  77  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  33.6 
 
 		 2836 aa  77  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  32.57 
 
 		 1557 aa  76.3  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.27 
 
 		 3168 aa  75.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  27.33 
 
 		 1156 aa  75.1  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2711  flagellar hook-associated protein 3  37.82 
 
 		 638 aa  73.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  41.46 
 
 		 1712 aa  73.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.85 
 
 		 4798 aa  73.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  27.36 
 
 		 2775 aa  73.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  31.29 
 
 		 1145 aa  73.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1424 aa  72.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  31.48 
 
 		 1895 aa  72.4  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 		 1610 aa  72.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  32.78 
 
 		 3619 aa  72  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  42.02 
 
 		 490 aa  71.6  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  27.82 
 
 		 764 aa  71.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  41.18 
 
 		 476 aa  70.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.06 
 
 		 1415 aa  71.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  44.57 
 
 		 475 aa  70.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.95 
 
 		 2678 aa  70.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  32.89 
 
 		 3608 aa  70.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 4800 aa  70.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  29.61 
 
 		 950 aa  70.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  38.17 
 
 		 476 aa  70.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  29.58 
 
 		 526 aa  70.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  30.67 
 
 		 613 aa  70.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  38.17 
 
 		 474 aa  68.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  33.67 
 
 		 243 aa  68.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  27.77 
 
 		 1607 aa  68.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>