16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0651 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1047  hypothetical protein  34.21 
 
 
6062 aa  768    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0593961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0651  hypothetical protein  100 
 
 
3954 aa  7618    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3762  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.7 
 
 
5342 aa  159  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1154  surface protein  30.63 
 
 
4713 aa  111  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  26.79 
 
 
12741 aa  98.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  26.78 
 
 
8980 aa  80.9  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.06 
 
 
956 aa  62  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  28.02 
 
 
1003 aa  59.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.52 
 
 
4500 aa  57.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.07 
 
 
985 aa  52  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  26.52 
 
 
2334 aa  50.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.26 
 
 
4016 aa  50.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  28.74 
 
 
2679 aa  48.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  28.12 
 
 
2328 aa  47.8  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0379  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.73 
 
 
1073 aa  46.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0161593  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  32.65 
 
 
1910 aa  46.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>