200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1693 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1693  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 		 933 aa  1785    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.78 
 
 		 444 aa  111  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  30 
 
 		 477 aa  106  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31280  flagellar capping protein  29.72 
 
 		 460 aa  102  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  27.16 
 
 		 469 aa  100  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  28.11 
 
 		 487 aa  100  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28 
 
 		 473 aa  99.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  26.9 
 
 		 632 aa  95.9  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.03 
 
 		 451 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 477 aa  95.9  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  28.02 
 
 		 665 aa  93.2  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.2 
 
 		 462 aa  93.6  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.89 
 
 		 455 aa  92.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  30.25 
 
 		 466 aa  90.5  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  26.56 
 
 		 490 aa  90.1  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  26.65 
 
 		 487 aa  89.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  32.81 
 
 		 474 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  30.25 
 
 		 466 aa  90.1  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.99 
 
 		 479 aa  89.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  28.01 
 
 		 456 aa  89  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  29.89 
 
 		 466 aa  88.2  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  26.09 
 
 		 445 aa  87.4  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.3 
 
 		 454 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.41 
 
 		 456 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.09 
 
 		 447 aa  87  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.96 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  32 
 
 		 502 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.11 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  27.1 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.71 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0984  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.95 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.42 
 
 		 453 aa  84  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.73 
 
 		 468 aa  84.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  26.11 
 
 		 438 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  29.45 
 
 		 12741 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.46 
 
 		 449 aa  83.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  31.37 
 
 		 458 aa  83.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.14 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.12 
 
 		 431 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.45 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.45 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  28.25 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.52 
 
 		 443 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.31 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4396  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.83 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.446586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.5 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  27.33 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.36 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  27.57 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.57 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.92 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.53 
 
 		 488 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  30.39 
 
 		 495 aa  77  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.23 
 
 		 456 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  26.61 
 
 		 452 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  23.88 
 
 		 454 aa  77  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4660  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.31 
 
 		 453 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  25.26 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.54 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.08 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  28.7 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.51 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.93 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  28.47 
 
 		 677 aa  74.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.64 
 
 		 457 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.66 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.5 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  28.69 
 
 		 500 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  28.32 
 
 		 513 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  22.99 
 
 		 437 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.73 
 
 		 587 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2353  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.94 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  27.02 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  24.91 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3568  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.03 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.888241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4166  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.13 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1580  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.18 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  22.67 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  28.04 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.37 
 
 		 458 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.33 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  27.88 
 
 		 507 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  34.38 
 
 		 669 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.07 
 
 		 680 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.07 
 
 		 680 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  27.88 
 
 		 507 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  27.94 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.94 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  27.88 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  24.92 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  24.92 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  27.88 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  27.88 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  27.88 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.08 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.08 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  25.38 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.77 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1035  flagellar capping protein  23.02 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3640  flagellar capping protein  25.32 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>