238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4160 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4160  VCBS  100 
 
 
6581 aa  12520    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.530259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3869  Ca 2+ binding protein  28.01 
 
 
1572 aa  119  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  26.25 
 
 
1855 aa  109  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  40.14 
 
 
848 aa  107  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  27.55 
 
 
1072 aa  103  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  29.39 
 
 
1079 aa  100  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 
12741 aa  99.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  36 
 
 
497 aa  99  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  25.34 
 
 
1217 aa  97.8  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  27.79 
 
 
589 aa  90.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  26.89 
 
 
4800 aa  86.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  28.34 
 
 
1424 aa  84.3  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  37.82 
 
 
623 aa  84.3  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  36.57 
 
 
856 aa  83.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29 
 
 
1400 aa  83.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  24.12 
 
 
2107 aa  82.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  37.61 
 
 
856 aa  81.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  37.25 
 
 
268 aa  78.2  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  33.2 
 
 
8980 aa  77  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  27.93 
 
 
1421 aa  73.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  32.21 
 
 
833 aa  71.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  41.13 
 
 
1112 aa  71.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2874  Cell division GTPase-like protein  36.09 
 
 
468 aa  70.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  28.79 
 
 
1884 aa  70.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  35.24 
 
 
683 aa  69.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.98 
 
 
2911 aa  68.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  29.36 
 
 
14829 aa  68.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  28.66 
 
 
2954 aa  68.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  26.12 
 
 
860 aa  67.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  25.09 
 
 
1156 aa  67.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  25.98 
 
 
4334 aa  67.4  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  29.19 
 
 
2097 aa  67.4  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 
736 aa  67  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4513  serine/threonine protein kinase  39.29 
 
 
644 aa  66.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.228895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  31.38 
 
 
724 aa  66.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  31.22 
 
 
3608 aa  66.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  29.7 
 
 
682 aa  65.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  26.07 
 
 
1145 aa  64.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1215  translation initiation factor IF-2  26.62 
 
 
1148 aa  64.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16026  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.42 
 
 
1499 aa  64.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  32.79 
 
 
2885 aa  64.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  30.29 
 
 
950 aa  63.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  24.77 
 
 
559 aa  63.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  28.96 
 
 
1286 aa  63.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 
709 aa  62.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  28.42 
 
 
3619 aa  62.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  28.6 
 
 
3619 aa  62.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  25.67 
 
 
928 aa  62.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  26.9 
 
 
15831 aa  62.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  42.57 
 
 
385 aa  62  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  25.06 
 
 
1279 aa  61.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  27.5 
 
 
880 aa  62  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  31.48 
 
 
946 aa  61.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  33.33 
 
 
478 aa  61.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0112  hypothetical protein  28.32 
 
 
677 aa  60.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0954339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  28.66 
 
 
764 aa  61.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  24.67 
 
 
1814 aa  61.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  33.48 
 
 
1712 aa  60.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  33.16 
 
 
1971 aa  60.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9182  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.55 
 
 
628 aa  60.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3265  sulfatase  32.68 
 
 
770 aa  60.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  26.54 
 
 
518 aa  60.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  34.03 
 
 
490 aa  60.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  24.01 
 
 
1628 aa  59.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  27.14 
 
 
1895 aa  60.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  26.87 
 
 
2836 aa  59.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 
588 aa  59.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  26.88 
 
 
534 aa  59.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  34.34 
 
 
1610 aa  59.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  41.46 
 
 
959 aa  58.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  37.7 
 
 
202 aa  58.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  32.43 
 
 
1557 aa  58.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  31.28 
 
 
357 aa  58.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  37.7 
 
 
202 aa  58.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.39 
 
 
2678 aa  58.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  43.17 
 
 
424 aa  58.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  40.62 
 
 
1112 aa  58.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.32 
 
 
2775 aa  58.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.33 
 
 
813 aa  57.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.42 
 
 
1019 aa  57.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.27 
 
 
1236 aa  57.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  31.58 
 
 
2950 aa  57.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  25.74 
 
 
1582 aa  57.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  25.75 
 
 
728 aa  56.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  33.14 
 
 
556 aa  57.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.81 
 
 
1415 aa  57  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  39.86 
 
 
1610 aa  56.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  37.04 
 
 
481 aa  56.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  28.33 
 
 
3094 aa  56.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  24.62 
 
 
795 aa  56.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  32.08 
 
 
313 aa  55.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  28.8 
 
 
313 aa  56.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  35.35 
 
 
3508 aa  55.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  29.41 
 
 
1805 aa  55.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 
467 aa  55.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  31.09 
 
 
491 aa  55.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  31.44 
 
 
2145 aa  55.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  31.07 
 
 
595 aa  55.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  24.8 
 
 
2133 aa  55.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  38.84 
 
 
245 aa  55.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>