More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1562 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  100 
 
 		 769 aa  1502    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  40.42 
 
 		 795 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  49.17 
 
 		 734 aa  302  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  51.46 
 
 		 741 aa  296  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  42.55 
 
 		 946 aa  185  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.56 
 
 		 1279 aa  161  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.75 
 
 		 1164 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  39.63 
 
 		 2105 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  36.43 
 
 		 2954 aa  154  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.18 
 
 		 1795 aa  151  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.2 
 
 		 595 aa  151  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  39.73 
 
 		 2775 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  42.62 
 
 		 4687 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.65 
 
 		 3427 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.39 
 
 		 980 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  37.53 
 
 		 1400 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  33.48 
 
 		 1532 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  37.74 
 
 		 1424 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  36.15 
 
 		 491 aa  140  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.12 
 
 		 1363 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  38.63 
 
 		 1287 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  37.14 
 
 		 1534 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33.1 
 
 		 2911 aa  138  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.61 
 
 		 2678 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  39.51 
 
 		 1043 aa  136  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.34 
 
 		 2667 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  34.59 
 
 		 613 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  33.85 
 
 		 4800 aa  134  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  39.72 
 
 		 526 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  46.57 
 
 		 460 aa  134  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  37.8 
 
 		 3608 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.62 
 
 		 3954 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.51 
 
 		 4334 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  37.02 
 
 		 833 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  33.98 
 
 		 965 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  38.86 
 
 		 1895 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.2 
 
 		 588 aa  127  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  33.59 
 
 		 1544 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  39.91 
 
 		 5171 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  51.66 
 
 		 686 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  33.87 
 
 		 1712 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  33.82 
 
 		 615 aa  124  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  46.67 
 
 		 850 aa  124  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  43.08 
 
 		 232 aa  124  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  35.74 
 
 		 2689 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  38.64 
 
 		 393 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.4 
 
 		 2668 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  38.61 
 
 		 387 aa  122  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  46.7 
 
 		 2145 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  40.35 
 
 		 341 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  31.72 
 
 		 1884 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 260 aa  121  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  32.93 
 
 		 556 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.68 
 
 		 1145 aa  120  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  34.94 
 
 		 1112 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  31.69 
 
 		 1072 aa  120  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  41.08 
 
 		 396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  44.57 
 
 		 245 aa  119  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  49.04 
 
 		 709 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.7 
 
 		 982 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.67 
 
 		 1963 aa  118  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  51.3 
 
 		 813 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  45.5 
 
 		 639 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  41.39 
 
 		 387 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  32.05 
 
 		 9867 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.99 
 
 		 3619 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  52.47 
 
 		 561 aa  116  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  36.62 
 
 		 437 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  51.33 
 
 		 219 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.88 
 
 		 1079 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  36.99 
 
 		 3619 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44 
 
 		 1236 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  30.98 
 
 		 1112 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  42.15 
 
 		 589 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  46.67 
 
 		 606 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  43.75 
 
 		 1855 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 		 2097 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  43.92 
 
 		 361 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  44.13 
 
 		 424 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.38 
 
 		 421 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  44.25 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  43.58 
 
 		 361 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  40.65 
 
 		 341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  52.52 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  43.58 
 
 		 361 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  44.78 
 
 		 460 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  41.05 
 
 		 728 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  38.19 
 
 		 518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  38.34 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  45.14 
 
 		 744 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  34.97 
 
 		 437 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  51.8 
 
 		 280 aa  111  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.15 
 
 		 833 aa  111  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  40.7 
 
 		 757 aa  110  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  34.35 
 
 		 4798 aa  109  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  40.1 
 
 		 1883 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  35.31 
 
 		 824 aa  107  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  47.37 
 
 		 679 aa  107  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  45.32 
 
 		 206 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.29 
 
 		 1016 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>