More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0275 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  52.16 
 
 		 232 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  46.94 
 
 		 946 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  51.88 
 
 		 1279 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.4 
 
 		 3954 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.26 
 
 		 1963 aa  98.2  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 260 aa  95.5  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  43.17 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.18 
 
 		 980 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  44.44 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  41.06 
 
 		 813 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43.84 
 
 		 460 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  37.81 
 
 		 1534 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.65 
 
 		 1164 aa  91.7  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44.3 
 
 		 1424 aa  92  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.4 
 
 		 4334 aa  90.5  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  40.33 
 
 		 1883 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  38.59 
 
 		 363 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  45.86 
 
 		 950 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.03 
 
 		 1795 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  38.93 
 
 		 526 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  41.22 
 
 		 938 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  41.86 
 
 		 595 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  39.44 
 
 		 795 aa  89.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.22 
 
 		 280 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.19 
 
 		 3427 aa  89.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.74 
 
 		 1363 aa  89  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  39.49 
 
 		 243 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.85 
 
 		 1016 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.22 
 
 		 280 aa  88.2  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.6 
 
 		 2105 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  35.8 
 
 		 769 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1493  Hemolysin-type calcium-binding region  35.55 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  35.62 
 
 		 491 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.1 
 
 		 588 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  42.18 
 
 		 2954 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  45.04 
 
 		 3619 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  40.27 
 
 		 4798 aa  86.3  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  45.04 
 
 		 3619 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  42.22 
 
 		 744 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  43.45 
 
 		 757 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  36.73 
 
 		 1287 aa  85.9  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  40.88 
 
 		 387 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  34.05 
 
 		 5171 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  35.59 
 
 		 724 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  38.67 
 
 		 361 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  44.6 
 
 		 361 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  44.6 
 
 		 361 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  37.97 
 
 		 1895 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  39.76 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2509  hemolysin-type calcium-binding region  39.46 
 
 		 865 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  42.34 
 
 		 2145 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  41.67 
 
 		 833 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  38.67 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.35 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  41.5 
 
 		 585 aa  82  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  37.58 
 
 		 982 aa  81.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47 
 
 		 577 aa  81.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  39.33 
 
 		 341 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2318  hypothetical protein  40.8 
 
 		 262 aa  81.3  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.571521  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.69 
 
 		 2668 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  38.82 
 
 		 686 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  44.27 
 
 		 709 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  37.24 
 
 		 1532 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  41.5 
 
 		 582 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40 
 
 		 1236 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  42.75 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  39.39 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  34.78 
 
 		 1043 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  35.22 
 
 		 741 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  37.74 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  37.97 
 
 		 850 aa  79  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  44.68 
 
 		 1594 aa  78.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  38.95 
 
 		 4687 aa  78.6  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  36.54 
 
 		 1197 aa  78.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  39.58 
 
 		 2689 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  38.75 
 
 		 245 aa  77.8  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 		 2336 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  37.93 
 
 		 742 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  33.51 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  40.28 
 
 		 1544 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.81 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  38.81 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  40.82 
 
 		 679 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.63 
 
 		 2678 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  39.01 
 
 		 1538 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  36.69 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  37.88 
 
 		 572 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  42.11 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  41.14 
 
 		 1400 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  36.81 
 
 		 734 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  34.22 
 
 		 639 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  35.1 
 
 		 717 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  42.28 
 
 		 824 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  40.54 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  41.86 
 
 		 1175 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.56 
 
 		 9867 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  38.79 
 
 		 1855 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>