More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2318 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2318  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  491  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.571521  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  40.28 
 
 
1287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  35 
 
 
982 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  37.55 
 
 
613 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  42.66 
 
 
2145 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
709 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  45.95 
 
 
1400 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.01 
 
 
577 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  45.39 
 
 
526 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  44.59 
 
 
946 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.05 
 
 
938 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  34.78 
 
 
393 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  48.06 
 
 
3954 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  38.18 
 
 
460 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  37.5 
 
 
833 aa  99.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.61 
 
 
980 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.51 
 
 
1795 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  38.64 
 
 
9867 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  44.7 
 
 
361 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  44.7 
 
 
361 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  44.7 
 
 
361 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  45.59 
 
 
595 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  43.14 
 
 
1197 aa  95.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.71 
 
 
2105 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  41.52 
 
 
1164 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  45.71 
 
 
1279 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  42.38 
 
 
2336 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.17 
 
 
219 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.07 
 
 
421 aa  92.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  44.52 
 
 
3619 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  38.76 
 
 
453 aa  92.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  39.43 
 
 
327 aa  92.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  41.04 
 
 
385 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  43.84 
 
 
3619 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  41.72 
 
 
424 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  40.12 
 
 
686 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.68 
 
 
3427 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  46.43 
 
 
4334 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44 
 
 
1424 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  40.65 
 
 
3608 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  40.7 
 
 
341 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  44.68 
 
 
1895 aa  89  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  41.13 
 
 
219 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  39.52 
 
 
1532 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  40.88 
 
 
615 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  38.06 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  42.31 
 
 
355 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.87 
 
 
1534 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.37 
 
 
2678 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  37.79 
 
 
5171 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  41.1 
 
 
363 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  35.43 
 
 
460 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  40.13 
 
 
491 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  34.8 
 
 
507 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  43.33 
 
 
280 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  34.56 
 
 
375 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  45.07 
 
 
2954 aa  85.1  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  41.78 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  40.8 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  47.14 
 
 
1544 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  38.18 
 
 
769 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  33.18 
 
 
686 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
795 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  41.18 
 
 
813 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  36.43 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.75 
 
 
588 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  41.73 
 
 
724 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.94 
 
 
1363 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  35.81 
 
 
517 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.67 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  39.24 
 
 
2689 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  34.56 
 
 
757 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  47.15 
 
 
1499 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  45.04 
 
 
1175 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  39.56 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  33.91 
 
 
5218 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  41.07 
 
 
582 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  37.43 
 
 
556 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  34.17 
 
 
744 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  38.01 
 
 
850 aa  82  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  41.07 
 
 
585 aa  82  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  39.31 
 
 
243 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  37.3 
 
 
606 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.44 
 
 
2668 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  35.32 
 
 
965 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.67 
 
 
1963 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  41.07 
 
 
679 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  42.57 
 
 
1022 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  42.57 
 
 
1017 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  35.93 
 
 
1043 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  38.41 
 
 
867 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  38.22 
 
 
2885 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  39.72 
 
 
639 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  42.96 
 
 
518 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  41.82 
 
 
824 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.98 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  36.36 
 
 
4798 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  35.38 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40.12 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  40.12 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>