More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8151 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 460 aa  878    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  91.74 
 
 		 460 aa  783    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  88.85 
 
 		 2668 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  66.22 
 
 		 980 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  59.26 
 
 		 615 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  54.08 
 
 		 341 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  52.27 
 
 		 341 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  52.54 
 
 		 526 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  60.18 
 
 		 686 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  51.26 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.41 
 
 		 1795 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  50 
 
 		 2105 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.29 
 
 		 1016 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.64 
 
 		 2667 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.35 
 
 		 1236 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  47.39 
 
 		 946 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  43.39 
 
 		 1164 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.23 
 
 		 1279 aa  163  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  42.42 
 
 		 1712 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  41.33 
 
 		 2775 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  39.37 
 
 		 2145 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 1287 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  46.09 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.87 
 
 		 982 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  37.12 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.24 
 
 		 9867 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.81 
 
 		 3427 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  42.97 
 
 		 2954 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  40.68 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  39.46 
 
 		 595 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  44.59 
 
 		 260 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  44.49 
 
 		 3954 aa  149  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  46.7 
 
 		 2885 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.8 
 
 		 1534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40 
 
 		 1363 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.12 
 
 		 1895 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45.8 
 
 		 1424 aa  143  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  39.62 
 
 		 833 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  46.45 
 
 		 4334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  45.67 
 
 		 219 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  46.46 
 
 		 361 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  46.46 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  36.09 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.94 
 
 		 588 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  36.6 
 
 		 245 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  36.78 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  48.29 
 
 		 1544 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  45.67 
 
 		 5171 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  45.21 
 
 		 437 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.43 
 
 		 2678 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.71 
 
 		 1963 aa  130  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  36.18 
 
 		 1532 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  41.22 
 
 		 1855 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  41.55 
 
 		 938 aa  130  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  41.71 
 
 		 361 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  35.5 
 
 		 1079 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  45.13 
 
 		 850 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  42.36 
 
 		 202 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  42.36 
 
 		 202 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  42.92 
 
 		 860 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  38.97 
 
 		 757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  39.16 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  46.53 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.56 
 
 		 3619 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.22 
 
 		 3619 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  41.08 
 
 		 1400 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  43.75 
 
 		 219 aa  126  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.58 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  39.02 
 
 		 589 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  37.94 
 
 		 387 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  42.54 
 
 		 561 aa  123  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  33.97 
 
 		 396 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40.28 
 
 		 813 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  32.41 
 
 		 2911 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  34.17 
 
 		 1156 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  45.62 
 
 		 734 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  39.84 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  38.41 
 
 		 965 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.25 
 
 		 2689 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  39.39 
 
 		 795 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.6 
 
 		 1499 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  37.42 
 
 		 855 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  32.04 
 
 		 3608 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  36.4 
 
 		 824 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  39.84 
 
 		 1883 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  43.56 
 
 		 741 aa  117  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.99 
 
 		 4687 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  42.08 
 
 		 606 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.52 
 
 		 4798 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  42.48 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  39.78 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  37.39 
 
 		 742 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  34.85 
 
 		 1197 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  38.4 
 
 		 273 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.35 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  43.35 
 
 		 950 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  44.57 
 
 		 232 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  37.76 
 
 		 280 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  34.48 
 
 		 1480 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  33.6 
 
 		 3209 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>