More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0405 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
709 aa  1399    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  54.92 
 
 
813 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  48.65 
 
 
260 aa  154  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.26 
 
 
588 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.7 
 
 
421 aa  147  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.83 
 
 
1963 aa  140  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  55.56 
 
 
946 aa  138  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  53.95 
 
 
3619 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  53.29 
 
 
3619 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  47.85 
 
 
1164 aa  135  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  40.43 
 
 
2145 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  47.7 
 
 
686 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  45.98 
 
 
950 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  49.47 
 
 
833 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.4 
 
 
3427 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  48.62 
 
 
982 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  48.57 
 
 
1424 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  39.02 
 
 
1287 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  46.49 
 
 
757 aa  127  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  46.34 
 
 
867 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  43.81 
 
 
606 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.62 
 
 
2667 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  40.37 
 
 
5171 aa  124  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  36.79 
 
 
424 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 
1795 aa  122  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  38.17 
 
 
615 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.78 
 
 
1236 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.71 
 
 
1895 aa  121  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  48.54 
 
 
2105 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  40.5 
 
 
850 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  42.17 
 
 
795 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.81 
 
 
938 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  40.17 
 
 
1883 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  48.47 
 
 
2885 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  40.64 
 
 
2775 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.29 
 
 
1016 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  39.48 
 
 
1712 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.54 
 
 
577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  46.45 
 
 
303 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  50 
 
 
3608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  43.41 
 
 
1175 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  46.2 
 
 
3954 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  48.54 
 
 
1279 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  41.3 
 
 
1534 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  47.85 
 
 
243 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  42.39 
 
 
1532 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  43.35 
 
 
639 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.6 
 
 
980 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  40.47 
 
 
280 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  38.91 
 
 
589 aa  114  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  50.99 
 
 
679 aa  113  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  37.15 
 
 
280 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  49.68 
 
 
2954 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
232 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  46.06 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  37.37 
 
 
741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  44.58 
 
 
686 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  37.89 
 
 
734 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43.71 
 
 
460 aa  111  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  42.11 
 
 
355 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  44.95 
 
 
1400 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  35.19 
 
 
2911 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  42.49 
 
 
1079 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  39.48 
 
 
518 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  46.51 
 
 
4687 aa  109  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  43.37 
 
 
202 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  32.85 
 
 
860 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  43.37 
 
 
202 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  36.69 
 
 
475 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.44 
 
 
2668 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  41.44 
 
 
1197 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  38.46 
 
 
3209 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  37.44 
 
 
385 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.89 
 
 
485 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  42.6 
 
 
959 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.22 
 
 
820 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  48.45 
 
 
4334 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  47.4 
 
 
1884 aa  107  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  46.82 
 
 
4800 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  39.78 
 
 
9867 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 
824 aa  105  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  38.97 
 
 
1383 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  47.1 
 
 
585 aa  105  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  44.71 
 
 
595 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  39.76 
 
 
572 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  35.89 
 
 
475 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  33.21 
 
 
437 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  44.2 
 
 
387 aa  103  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
724 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  46.45 
 
 
582 aa  103  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  40.86 
 
 
769 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  36.32 
 
 
257 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.2 
 
 
833 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  41.24 
 
 
245 aa  102  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  49.64 
 
 
942 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  43.71 
 
 
460 aa  102  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  36.74 
 
 
437 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  38.55 
 
 
1043 aa  101  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  33.48 
 
 
375 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.75 
 
 
453 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0626056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>