More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1493 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1493  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.11 
 
 		 3427 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  41.86 
 
 		 833 aa  95.9  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  41.82 
 
 		 615 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.42 
 
 		 4334 aa  89.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  39.89 
 
 		 1532 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  41.52 
 
 		 946 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  36.32 
 
 		 460 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  36.76 
 
 		 460 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  38.54 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  39.58 
 
 		 361 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  39.58 
 
 		 361 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  34.43 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  39.2 
 
 		 1164 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  35.21 
 
 		 526 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.65 
 
 		 3954 aa  86.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 709 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.43 
 
 		 1795 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.34 
 
 		 1534 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  39.74 
 
 		 361 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.6 
 
 		 588 aa  85.1  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.48 
 
 		 2105 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  37.29 
 
 		 595 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.8 
 
 		 824 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.38 
 
 		 1363 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.35 
 
 		 1279 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  43.71 
 
 		 1383 aa  82.4  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  38.46 
 
 		 2954 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  35.27 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  36.07 
 
 		 5171 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  37.84 
 
 		 813 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.63 
 
 		 980 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  40.96 
 
 		 1895 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  37.76 
 
 		 850 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.17 
 
 		 1424 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.27 
 
 		 1963 aa  78.6  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  41.03 
 
 		 757 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  36.99 
 
 		 1287 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  35.51 
 
 		 1855 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  38.15 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  38.04 
 
 		 1400 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  34.68 
 
 		 613 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  35.75 
 
 		 938 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  35.38 
 
 		 686 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 		 795 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0892  hypothetical protein  33.53 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  40.13 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  40.13 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  37.79 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.51 
 
 		 1197 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.52 
 
 		 2668 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  37.3 
 
 		 965 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  38.96 
 
 		 679 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 		 982 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  37.02 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  37.36 
 
 		 2775 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  36.31 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  38.85 
 
 		 585 aa  72  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  42.75 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  42.75 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  38.32 
 
 		 950 aa  71.6  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 		 4800 aa  71.6  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  37.87 
 
 		 2145 aa  71.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  38.85 
 
 		 582 aa  71.6  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  38.15 
 
 		 639 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 1712 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  34.69 
 
 		 1544 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  38.25 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  36.7 
 
 		 1043 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  36.16 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  47.52 
 
 		 3619 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.91 
 
 		 1145 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  47.52 
 
 		 3619 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.99 
 
 		 421 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  35.56 
 
 		 3209 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 9867 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.75 
 
 		 2678 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  36.09 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  36.47 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  35.52 
 
 		 387 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  37.7 
 
 		 437 aa  68.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  33.96 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  46.08 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  40.34 
 
 		 934 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  37.79 
 
 		 4687 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1526 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  32.26 
 
 		 1421 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  34.3 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  30.88 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  36.42 
 
 		 724 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  31.11 
 
 		 572 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  34.73 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  38.6 
 
 		 1538 aa  65.9  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.17 
 
 		 1236 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  34.1 
 
 		 1650 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  40.16 
 
 		 1156 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  33.89 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.88 
 
 		 2667 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.61 
 
 		 1180 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>