More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0246 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  100 
 
 		 1156 aa  2198    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  90.87 
 
 		 1499 aa  1449    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  41.64 
 
 		 1480 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  43.6 
 
 		 855 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  35.94 
 
 		 2954 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 2107 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  34.69 
 
 		 1217 aa  425  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 1789 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  34.91 
 
 		 1814 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.27 
 
 		 3598 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  33.37 
 
 		 4798 aa  348  4e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  31.32 
 
 		 860 aa  316  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  27.77 
 
 		 2245 aa  312  2e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.74 
 
 		 1363 aa  295  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.66 
 
 		 1607 aa  295  4e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  29.53 
 
 		 3209 aa  289  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  44.12 
 
 		 999 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.29 
 
 		 1400 aa  271  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.22 
 
 		 3954 aa  253  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  29.86 
 
 		 1532 aa  251  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.04 
 
 		 946 aa  249  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  33.38 
 
 		 1383 aa  249  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.02 
 
 		 4334 aa  244  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.92 
 
 		 1279 aa  229  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  30.56 
 
 		 1079 aa  221  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  26.18 
 
 		 1925 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  29.29 
 
 		 4687 aa  217  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.29 
 
 		 1197 aa  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.26 
 
 		 2689 aa  207  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  32 
 
 		 2911 aa  206  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  33.98 
 
 		 965 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  31.03 
 
 		 1855 aa  197  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.22 
 
 		 1145 aa  195  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  31.47 
 
 		 1884 aa  194  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.6 
 
 		 2678 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.16 
 
 		 1415 aa  190  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  30.45 
 
 		 1164 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  33.81 
 
 		 1112 aa  183  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  31.38 
 
 		 4800 aa  179  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  29.93 
 
 		 2836 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.2 
 
 		 1534 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  29.93 
 
 		 1895 aa  172  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.71 
 
 		 1180 aa  171  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  33.28 
 
 		 556 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.87 
 
 		 1795 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  37.9 
 
 		 959 aa  162  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  30.34 
 
 		 1421 aa  162  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  36.48 
 
 		 2105 aa  161  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.96 
 
 		 595 aa  160  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1424 aa  159  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  29.82 
 
 		 2097 aa  159  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  33.69 
 
 		 2775 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  26.1 
 
 		 1168 aa  156  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.33 
 
 		 2667 aa  154  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.94 
 
 		 824 aa  153  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  30.33 
 
 		 942 aa  153  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1306 aa  149  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  31.01 
 
 		 833 aa  148  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  27.08 
 
 		 4723 aa  147  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.23 
 
 		 980 aa  145  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  29.55 
 
 		 1582 aa  144  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  26.74 
 
 		 2467 aa  144  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.25 
 
 		 3619 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  37.39 
 
 		 387 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  33.17 
 
 		 1544 aa  142  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.01 
 
 		 3427 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.47 
 
 		 3619 aa  141  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  37.7 
 
 		 387 aa  138  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  38.03 
 
 		 341 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  26.55 
 
 		 15831 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  28.23 
 
 		 928 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  31.17 
 
 		 526 aa  136  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.98 
 
 		 3608 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  33.7 
 
 		 1287 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  30.49 
 
 		 518 aa  131  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  30.72 
 
 		 928 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  37.13 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  33.09 
 
 		 393 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  35.4 
 
 		 615 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  29.33 
 
 		 9867 aa  128  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28.17 
 
 		 3026 aa  127  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  40.65 
 
 		 833 aa  127  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  31.74 
 
 		 613 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  34.49 
 
 		 460 aa  126  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  32.65 
 
 		 820 aa  123  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  35.64 
 
 		 341 aa  121  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  30.58 
 
 		 932 aa  121  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  34.19 
 
 		 485 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.29 
 
 		 1839 aa  120  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  25.94 
 
 		 14829 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  31.22 
 
 		 516 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 491 aa  119  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  28.78 
 
 		 692 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  32.72 
 
 		 589 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50.65 
 
 		 260 aa  118  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  30.84 
 
 		 795 aa  118  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  25.55 
 
 		 2133 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.02 
 
 		 1236 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  30.98 
 
 		 5769 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.49 
 
 		 1403 aa  116  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>