More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4552 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 686 aa  1361    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  45.81 
 
 		 608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  38.94 
 
 		 907 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  44.58 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  40.14 
 
 		 465 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  53.11 
 
 		 385 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  41.29 
 
 		 375 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  48.51 
 
 		 606 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  47.71 
 
 		 424 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 		 306 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 427 aa  157  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  38.59 
 
 		 320 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  47.7 
 
 		 709 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  48.78 
 
 		 1175 aa  123  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  42.27 
 
 		 1164 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.63 
 
 		 3427 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  50.6 
 
 		 1895 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  31.15 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  46.86 
 
 		 2145 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  44 
 
 		 813 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  44.6 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.37 
 
 		 421 aa  117  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.34 
 
 		 588 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  42.01 
 
 		 260 aa  117  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.24 
 
 		 1236 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.33 
 
 		 1963 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  41.98 
 
 		 615 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  47.83 
 
 		 1424 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.75 
 
 		 2954 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  51.02 
 
 		 2105 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  48.7 
 
 		 946 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  44.64 
 
 		 639 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  49.65 
 
 		 2667 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.68 
 
 		 1795 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.38 
 
 		 980 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  46.3 
 
 		 1534 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  37.09 
 
 		 938 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  47.17 
 
 		 679 aa  109  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 5171 aa  109  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 589 aa  109  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  47.95 
 
 		 982 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.08 
 
 		 3619 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  41.67 
 
 		 850 aa  108  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  40.73 
 
 		 3619 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  45.93 
 
 		 1197 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  44.07 
 
 		 3954 aa  107  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.58 
 
 		 686 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.81 
 
 		 2668 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  40.36 
 
 		 1079 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 		 561 aa  105  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  46.47 
 
 		 202 aa  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  46.47 
 
 		 202 aa  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  45.91 
 
 		 582 aa  104  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  43.41 
 
 		 387 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  46 
 
 		 867 aa  104  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  45.91 
 
 		 585 aa  104  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  36.36 
 
 		 883 aa  104  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  46.98 
 
 		 2885 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  43.79 
 
 		 833 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.72 
 
 		 2678 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  41.71 
 
 		 1287 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 		 4334 aa  102  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  45.95 
 
 		 572 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 1400 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  32.63 
 
 		 4687 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  39.11 
 
 		 357 aa  101  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.86 
 
 		 1279 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  48.63 
 
 		 491 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  41.21 
 
 		 742 aa  100  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.49 
 
 		 1363 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  44 
 
 		 460 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  44.81 
 
 		 396 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  47.26 
 
 		 243 aa  99.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 		 284 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  42.61 
 
 		 757 aa  98.2  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  39.7 
 
 		 1855 aa  98.2  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  45.64 
 
 		 795 aa  97.4  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  48 
 
 		 950 aa  97.4  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.63 
 
 		 1712 aa  97.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.94 
 
 		 485 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  48.09 
 
 		 303 aa  97.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  45.57 
 
 		 526 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  36.02 
 
 		 820 aa  97.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  45.7 
 
 		 724 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  35.96 
 
 		 1383 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  45.16 
 
 		 595 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  46.84 
 
 		 518 aa  96.3  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.25 
 
 		 1016 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  30.86 
 
 		 409 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.52 
 
 		 577 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  50 
 
 		 2775 aa  95.1  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  44.3 
 
 		 245 aa  94.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 1332 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  42.59 
 
 		 257 aa  94.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  38.97 
 
 		 1145 aa  94.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  46.36 
 
 		 280 aa  94.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  42.54 
 
 		 3209 aa  94  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  42.37 
 
 		 1532 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  41.81 
 
 		 219 aa  94  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  40.29 
 
 		 460 aa  94  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>