172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5109 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 409 aa  843    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  56.6 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  51.36 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.32 
 
 		 633 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  40.69 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  44.4 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  45.15 
 
 		 291 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  41.7 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  42.86 
 
 		 883 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.43 
 
 		 1290 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  40 
 
 		 1059 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  70 
 
 		 603 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.51 
 
 		 819 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.98 
 
 		 627 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  39.84 
 
 		 642 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  36.87 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  39.84 
 
 		 641 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  43.43 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.74 
 
 		 282 aa  177  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.7 
 
 		 288 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  63.91 
 
 		 639 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 		 1321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  45.19 
 
 		 556 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.59 
 
 		 252 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  39.59 
 
 		 423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  41.48 
 
 		 752 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.08 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.84 
 
 		 306 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  40.41 
 
 		 276 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  39.64 
 
 		 1028 aa  163  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  53.38 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  42.91 
 
 		 569 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  39.77 
 
 		 1332 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  39.92 
 
 		 289 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  62.81 
 
 		 1115 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  39.04 
 
 		 588 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  36.33 
 
 		 694 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.58 
 
 		 532 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.09 
 
 		 1694 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  36.77 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  33.46 
 
 		 313 aa  155  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  36.36 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  38.02 
 
 		 1441 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  35.27 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.88 
 
 		 742 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.98 
 
 		 547 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  38.03 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  52.74 
 
 		 627 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  41 
 
 		 286 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  38.67 
 
 		 384 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.64 
 
 		 912 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  37.84 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  37.86 
 
 		 301 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.99 
 
 		 328 aa  146  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  36.49 
 
 		 1918 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  37.45 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  41.98 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.19 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  36.02 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.32 
 
 		 884 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  34.18 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  36.92 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  32.95 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.76 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  36.29 
 
 		 238 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.46 
 
 		 261 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  36.44 
 
 		 271 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  35.93 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  35.22 
 
 		 722 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  34.04 
 
 		 479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  34.31 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  35.74 
 
 		 269 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 		 260 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 		 306 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  32.38 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  29.5 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  33.68 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  29.15 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  27.15 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.54 
 
 		 1707 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  30.64 
 
 		 608 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  31.23 
 
 		 465 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  30.28 
 
 		 475 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  27.42 
 
 		 263 aa  96.7  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 346 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  44.72 
 
 		 1010 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 		 686 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  32.42 
 
 		 308 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  32.47 
 
 		 539 aa  93.2  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  29.72 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 907 aa  90.9  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  29.84 
 
 		 275 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  30.56 
 
 		 275 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  32.99 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.33 
 
 		 815 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  38.73 
 
 		 358 aa  86.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  37.14 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>