155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2607 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  100 
 
 		 883 aa  1788    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  40.54 
 
 		 1321 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.64 
 
 		 1694 aa  324  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.34 
 
 		 1290 aa  240  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  35.35 
 
 		 641 aa  228  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  35.67 
 
 		 642 aa  227  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.57 
 
 		 627 aa  223  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  47.79 
 
 		 423 aa  212  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  37.2 
 
 		 328 aa  210  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  43.85 
 
 		 279 aa  207  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  46.89 
 
 		 291 aa  207  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  43.22 
 
 		 281 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  47.39 
 
 		 289 aa  204  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  43.19 
 
 		 282 aa  201  7e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.49 
 
 		 884 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.77 
 
 		 742 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.07 
 
 		 633 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.73 
 
 		 532 aa  191  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.46 
 
 		 288 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.89 
 
 		 912 aa  190  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  38.97 
 
 		 291 aa  187  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  41.83 
 
 		 276 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  39.93 
 
 		 1918 aa  186  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.01 
 
 		 358 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  41.57 
 
 		 426 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  41.73 
 
 		 283 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  43.5 
 
 		 383 aa  181  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  42.86 
 
 		 409 aa  180  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  37.68 
 
 		 694 aa  179  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  39.15 
 
 		 1028 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  41.25 
 
 		 588 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  38.55 
 
 		 503 aa  174  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.18 
 
 		 252 aa  174  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  40.49 
 
 		 286 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  39.15 
 
 		 301 aa  168  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  41.04 
 
 		 569 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  40 
 
 		 274 aa  165  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  37.69 
 
 		 556 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  35.36 
 
 		 1059 aa  160  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  37.08 
 
 		 330 aa  159  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  40.32 
 
 		 286 aa  157  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  37.96 
 
 		 469 aa  157  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.86 
 
 		 328 aa  156  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  37.16 
 
 		 389 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.49 
 
 		 315 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 		 427 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  37.6 
 
 		 1332 aa  148  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  37.07 
 
 		 384 aa  144  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.43 
 
 		 819 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.45 
 
 		 306 aa  134  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  36.27 
 
 		 320 aa  134  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.34 
 
 		 547 aa  133  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.37 
 
 		 290 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  36.33 
 
 		 271 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  34.05 
 
 		 1441 aa  125  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  34.98 
 
 		 286 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.92 
 
 		 261 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 		 752 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 		 394 aa  121  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  33.88 
 
 		 238 aa  117  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  29.12 
 
 		 277 aa  117  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  32.04 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  31.09 
 
 		 608 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 907 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.46 
 
 		 1707 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  32.5 
 
 		 470 aa  115  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 		 306 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  29.94 
 
 		 464 aa  114  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  39.45 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  28.17 
 
 		 479 aa  112  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  31.54 
 
 		 334 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  32.3 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  31.56 
 
 		 295 aa  111  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  32.35 
 
 		 313 aa  111  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  30.22 
 
 		 475 aa  111  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  32.26 
 
 		 469 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 		 260 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  30.48 
 
 		 319 aa  108  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  31.84 
 
 		 275 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  30.47 
 
 		 479 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  31.89 
 
 		 263 aa  105  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 686 aa  105  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  33.65 
 
 		 465 aa  105  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.41 
 
 		 722 aa  104  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 346 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  35.83 
 
 		 467 aa  102  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 		 449 aa  97.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  30.42 
 
 		 337 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  30.04 
 
 		 388 aa  93.6  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.94 
 
 		 639 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  27.89 
 
 		 477 aa  93.6  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.34 
 
 		 1007 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  28.57 
 
 		 318 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.02 
 
 		 915 aa  87.8  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.29 
 
 		 815 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  30.92 
 
 		 275 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  31.09 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  31.6 
 
 		 275 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  24.83 
 
 		 842 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>