More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1895 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  100 
 
 		 850 aa  1672    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.72 
 
 		 3427 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.96 
 
 		 1795 aa  170  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  47.48 
 
 		 946 aa  167  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  47.23 
 
 		 2105 aa  159  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.22 
 
 		 980 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  38.4 
 
 		 1164 aa  157  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.92 
 
 		 1279 aa  154  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1424 aa  153  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 		 588 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  43.14 
 
 		 833 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.81 
 
 		 2668 aa  153  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.57 
 
 		 1534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.39 
 
 		 3954 aa  147  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  39.81 
 
 		 1895 aa  146  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  42.01 
 
 		 2954 aa  144  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  39.58 
 
 		 526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.69 
 
 		 2667 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  40.22 
 
 		 595 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  40.68 
 
 		 2689 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  46.45 
 
 		 982 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  39.33 
 
 		 4334 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.99 
 
 		 9867 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  48.94 
 
 		 813 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  38.51 
 
 		 1532 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.59 
 
 		 3619 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.59 
 
 		 3619 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.7 
 
 		 1236 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  49.44 
 
 		 757 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  38.77 
 
 		 709 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  39.04 
 
 		 2145 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  35.25 
 
 		 387 aa  130  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  51.05 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.66 
 
 		 1363 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  39.59 
 
 		 1287 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  36.67 
 
 		 615 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43.1 
 
 		 460 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  41.47 
 
 		 363 aa  128  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.47 
 
 		 2678 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  34.08 
 
 		 1079 aa  127  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  47.37 
 
 		 355 aa  127  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  37.66 
 
 		 795 aa  127  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 		 1400 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  35.65 
 
 		 613 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 639 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  36.02 
 
 		 1383 aa  126  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  46.5 
 
 		 1544 aa  126  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  37.58 
 
 		 437 aa  126  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  41.95 
 
 		 491 aa  126  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  39.22 
 
 		 341 aa  126  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  44.35 
 
 		 460 aa  125  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  38.39 
 
 		 589 aa  125  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  40.47 
 
 		 437 aa  125  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  36.28 
 
 		 387 aa  124  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  36.94 
 
 		 4687 aa  124  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  39.87 
 
 		 1043 aa  124  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  42.23 
 
 		 5171 aa  123  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  41.03 
 
 		 561 aa  122  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.06 
 
 		 2775 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  35.75 
 
 		 965 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  37.38 
 
 		 341 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  47.67 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  42.64 
 
 		 824 aa  119  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.88 
 
 		 421 aa  118  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  40.66 
 
 		 1855 aa  118  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.33 
 
 		 1712 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  35.04 
 
 		 393 aa  117  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  33.03 
 
 		 556 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  41.7 
 
 		 1883 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  44.79 
 
 		 950 aa  117  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  37.01 
 
 		 396 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  48.75 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  51.92 
 
 		 202 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  51.92 
 
 		 202 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 686 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.51 
 
 		 3608 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  38.11 
 
 		 424 aa  114  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  34.24 
 
 		 2133 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.7 
 
 		 1016 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  34.46 
 
 		 4800 aa  112  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  45.03 
 
 		 1197 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.78 
 
 		 1963 aa  112  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.36 
 
 		 820 aa  111  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  38.93 
 
 		 357 aa  111  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  42.58 
 
 		 582 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  45.4 
 
 		 243 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  43.88 
 
 		 734 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  32.69 
 
 		 938 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  34.05 
 
 		 518 aa  108  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  36.26 
 
 		 329 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  36.26 
 
 		 329 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  51.35 
 
 		 280 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  40.21 
 
 		 833 aa  107  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.36 
 
 		 3209 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  45.45 
 
 		 686 aa  107  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  35.8 
 
 		 1156 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  37.88 
 
 		 648 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.48 
 
 		 2911 aa  105  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  37.11 
 
 		 313 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  45.45 
 
 		 280 aa  105  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>