More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0803 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  55.95 
 
 		 2796 aa  766    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  74.09 
 
 		 2775 aa  3753    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  100 
 
 		 2667 aa  5178    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  50.23 
 
 		 945 aa  580  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.94 
 
 		 980 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  44.51 
 
 		 657 aa  523  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.76 
 
 		 3977 aa  506  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  87.74 
 
 		 1236 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  42.74 
 
 		 1355 aa  484  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  44.49 
 
 		 808 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  45.82 
 
 		 2852 aa  484  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6734  5'-Nucleotidase domain protein  44.23 
 
 		 726 aa  476  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3214  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.75 
 
 		 668 aa  472  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  47.78 
 
 		 2885 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  43.12 
 
 		 748 aa  443  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.16 
 
 		 1148 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.6 
 
 		 1148 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.35 
 
 		 2346 aa  408  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  42 
 
 		 1123 aa  395  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.95 
 
 		 1075 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.44 
 
 		 1641 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.47 
 
 		 641 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.25 
 
 		 1641 aa  376  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  41.18 
 
 		 780 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  40.69 
 
 		 780 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  69.97 
 
 		 1712 aa  359  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.88 
 
 		 1266 aa  349  5e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 		 942 aa  336  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.04 
 
 		 1052 aa  334  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.24 
 
 		 826 aa  328  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  37.22 
 
 		 1310 aa  327  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.28 
 
 		 947 aa  320  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.15 
 
 		 601 aa  317  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.7 
 
 		 945 aa  304  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  36.01 
 
 		 944 aa  301  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.63 
 
 		 573 aa  300  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  35.86 
 
 		 1346 aa  300  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.03 
 
 		 848 aa  300  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  28.94 
 
 		 1652 aa  299  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  36.16 
 
 		 944 aa  299  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  36.01 
 
 		 944 aa  297  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.06 
 
 		 944 aa  296  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  36.01 
 
 		 944 aa  295  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.13 
 
 		 1525 aa  295  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  35.57 
 
 		 795 aa  295  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.94 
 
 		 624 aa  290  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.65 
 
 		 818 aa  290  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  34.94 
 
 		 624 aa  290  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.71 
 
 		 940 aa  290  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  34.94 
 
 		 624 aa  290  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.94 
 
 		 624 aa  290  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  34.94 
 
 		 624 aa  290  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  36.48 
 
 		 1503 aa  289  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.56 
 
 		 955 aa  290  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.94 
 
 		 624 aa  289  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.84 
 
 		 603 aa  289  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 		 818 aa  288  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  35.24 
 
 		 948 aa  285  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  36.41 
 
 		 948 aa  283  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  28.1 
 
 		 1512 aa  283  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  34.29 
 
 		 622 aa  282  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  35.19 
 
 		 948 aa  282  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.28 
 
 		 621 aa  278  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 		 604 aa  277  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 		 600 aa  275  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.03 
 
 		 604 aa  275  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.66 
 
 		 627 aa  275  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.52 
 
 		 942 aa  274  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.24 
 
 		 1052 aa  274  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  29.23 
 
 		 1577 aa  270  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.76 
 
 		 604 aa  270  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  35.77 
 
 		 948 aa  270  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.23 
 
 		 604 aa  270  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.07 
 
 		 604 aa  269  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.07 
 
 		 604 aa  269  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 		 586 aa  266  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.44 
 
 		 653 aa  264  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  28.02 
 
 		 1591 aa  261  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  35.1 
 
 		 514 aa  260  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  27.79 
 
 		 1577 aa  258  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  28.57 
 
 		 1506 aa  254  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.42 
 
 		 1284 aa  254  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.65 
 
 		 620 aa  253  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 		 599 aa  253  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.49 
 
 		 620 aa  250  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.77 
 
 		 929 aa  249  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  34.02 
 
 		 619 aa  246  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  34.02 
 
 		 619 aa  246  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.1 
 
 		 868 aa  243  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  43.09 
 
 		 2105 aa  229  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.29 
 
 		 1795 aa  223  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  31.98 
 
 		 613 aa  221  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  31.8 
 
 		 902 aa  211  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  42.9 
 
 		 526 aa  210  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  31.16 
 
 		 572 aa  202  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  44.62 
 
 		 460 aa  195  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  29 
 
 		 869 aa  195  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 		 481 aa  194  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.66 
 
 		 2668 aa  191  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  31.09 
 
 		 863 aa  191  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>