More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0281 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  100 
 
 		 686 aa  1362    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  53.46 
 
 		 998 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  73.76 
 
 		 615 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  63 
 
 		 341 aa  282  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  67.48 
 
 		 341 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  58.65 
 
 		 980 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  61.99 
 
 		 460 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  60.96 
 
 		 2668 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  58.48 
 
 		 460 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  57.47 
 
 		 2105 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.45 
 
 		 1795 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  58.37 
 
 		 363 aa  211  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  55.25 
 
 		 526 aa  210  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.28 
 
 		 1016 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.84 
 
 		 1236 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  50 
 
 		 2667 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  49.04 
 
 		 2885 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  50.51 
 
 		 1712 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  47.58 
 
 		 2775 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  45.53 
 
 		 3619 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  47.25 
 
 		 3619 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  41.36 
 
 		 260 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  38.55 
 
 		 245 aa  129  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  44.88 
 
 		 946 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  41.82 
 
 		 219 aa  127  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  48.7 
 
 		 1424 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  36.7 
 
 		 606 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  34.22 
 
 		 757 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.65 
 
 		 219 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  42.27 
 
 		 1532 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  43.84 
 
 		 860 aa  124  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  45.42 
 
 		 3608 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  41.36 
 
 		 202 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  41.36 
 
 		 202 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 		 467 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  37.18 
 
 		 1544 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38.94 
 
 		 813 aa  121  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  39.91 
 
 		 3954 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.07 
 
 		 588 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.23 
 
 		 3427 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  39.62 
 
 		 2954 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  37.79 
 
 		 9867 aa  117  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.63 
 
 		 1164 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  37.7 
 
 		 1534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  47.98 
 
 		 959 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  37.22 
 
 		 950 aa  115  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2004  protein of unknown function DUF1555  28.35 
 
 		 577 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.28 
 
 		 421 aa  114  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.35 
 
 		 1963 aa  114  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  39.74 
 
 		 589 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  48 
 
 		 1287 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  44.58 
 
 		 709 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  42.79 
 
 		 1400 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  37.33 
 
 		 243 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  43.51 
 
 		 613 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.22 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1977  protein of unknown function DUF1555  28.49 
 
 		 577 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  42.86 
 
 		 938 aa  111  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  46.39 
 
 		 361 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  38.46 
 
 		 595 aa  110  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  37.83 
 
 		 769 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.16 
 
 		 1279 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  43.56 
 
 		 5171 aa  110  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  45.23 
 
 		 1895 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  45.78 
 
 		 361 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  45.78 
 
 		 361 aa  109  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  47.93 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  47.62 
 
 		 639 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  44.52 
 
 		 4798 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  43.93 
 
 		 1499 aa  108  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  37.73 
 
 		 2145 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.76 
 
 		 485 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 		 491 aa  107  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  41.43 
 
 		 907 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.82 
 
 		 1363 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  39.07 
 
 		 4687 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  37.56 
 
 		 1175 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  42.5 
 
 		 1156 aa  104  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  47.26 
 
 		 396 aa  104  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  35.74 
 
 		 1383 aa  104  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.83 
 
 		 4334 aa  103  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  46.98 
 
 		 686 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  47.26 
 
 		 280 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  37.02 
 
 		 393 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  40.41 
 
 		 833 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  39.01 
 
 		 724 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  34.71 
 
 		 1022 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  40.33 
 
 		 1079 aa  102  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  40.61 
 
 		 232 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  46.58 
 
 		 280 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  34.71 
 
 		 1017 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  41.18 
 
 		 1650 aa  101  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  39 
 
 		 982 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  38.81 
 
 		 734 aa  101  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  38.52 
 
 		 387 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  40.1 
 
 		 1814 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  34.89 
 
 		 424 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  47.71 
 
 		 833 aa  100  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  38.5 
 
 		 273 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  33.97 
 
 		 475 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>