More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0082 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  100 
 
 		 355 aa  662    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  45.62 
 
 		 946 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.22 
 
 		 980 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  46.63 
 
 		 2954 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.28 
 
 		 3954 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.83 
 
 		 1963 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  44.93 
 
 		 1400 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43.56 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  44.39 
 
 		 795 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  35.85 
 
 		 1287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  42.32 
 
 		 850 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50.68 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.02 
 
 		 3427 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.36 
 
 		 1279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  43.93 
 
 		 813 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  46.04 
 
 		 982 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.13 
 
 		 2668 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  47.09 
 
 		 950 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.06 
 
 		 1164 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  48.42 
 
 		 4334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  42.86 
 
 		 833 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  42.11 
 
 		 709 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.55 
 
 		 1795 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  42.08 
 
 		 5171 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  47.93 
 
 		 686 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  42.03 
 
 		 1544 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.08 
 
 		 2105 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40.41 
 
 		 1424 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.21 
 
 		 3619 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  34.98 
 
 		 2145 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  46.19 
 
 		 757 aa  106  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  38.83 
 
 		 526 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 		 615 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  45.54 
 
 		 460 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  37.82 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  35.4 
 
 		 734 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 588 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  44.92 
 
 		 595 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  35.4 
 
 		 741 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  36.79 
 
 		 613 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  41.31 
 
 		 387 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  41.67 
 
 		 585 aa  102  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  52.52 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2761  type I secretion target repeat-containing protein  37.35 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0511056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  41.67 
 
 		 582 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  52.52 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  40.31 
 
 		 679 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  32.72 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.94 
 
 		 1016 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.38 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  44.72 
 
 		 729 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  41.94 
 
 		 1895 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  40.43 
 
 		 491 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  42.08 
 
 		 518 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  46.2 
 
 		 3619 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.9 
 
 		 1534 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  39.52 
 
 		 724 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  50.71 
 
 		 219 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  43.48 
 
 		 1532 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  46.94 
 
 		 202 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.25 
 
 		 2667 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  46.94 
 
 		 202 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  41.84 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  41.98 
 
 		 3608 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  49.2 
 
 		 4687 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  42.65 
 
 		 742 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.57 
 
 		 1197 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  40.88 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  44.2 
 
 		 965 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  34.08 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  41.57 
 
 		 232 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.21 
 
 		 1363 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  44.72 
 
 		 686 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  42.73 
 
 		 1855 aa  93.6  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  38.93 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  40.45 
 
 		 938 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34.78 
 
 		 9867 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  40.34 
 
 		 1079 aa  93.2  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1131  hemolysin-type calcium-binding region  31.89 
 
 		 336 aa  93.2  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  43.06 
 
 		 572 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  38.39 
 
 		 589 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  37.67 
 
 		 824 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.33 
 
 		 1236 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  43.27 
 
 		 4800 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  36.32 
 
 		 4798 aa  90.9  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  39.15 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  40 
 
 		 2689 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  38.33 
 
 		 437 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  34.7 
 
 		 385 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.96 
 
 		 1019 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  44.83 
 
 		 867 aa  89.7  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  43.21 
 
 		 717 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  39.29 
 
 		 833 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.78 
 
 		 485 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  39.81 
 
 		 437 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.65 
 
 		 2678 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  32.43 
 
 		 219 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  34.55 
 
 		 245 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  44.35 
 
 		 1175 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>