More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1884 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
588 aa  1135    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  62.33 
 
 
1372 aa  246  8e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  50.16 
 
 
813 aa  237  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  51.58 
 
 
1164 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  39.78 
 
 
1055 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  55.72 
 
 
946 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  45.1 
 
 
1175 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  42.57 
 
 
1019 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  51.66 
 
 
1424 aa  160  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  46.61 
 
 
2105 aa  156  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.75 
 
 
2667 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  45.37 
 
 
709 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.82 
 
 
1795 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.48 
 
 
3427 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  54.59 
 
 
833 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.93 
 
 
1236 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  48.58 
 
 
491 aa  151  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  50.26 
 
 
709 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.5 
 
 
3619 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  48.79 
 
 
1279 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  45.7 
 
 
1895 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.94 
 
 
2668 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  43.29 
 
 
652 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  45.2 
 
 
3619 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  39.06 
 
 
1022 aa  144  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  39.06 
 
 
1017 aa  144  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.91 
 
 
1712 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  44.07 
 
 
1534 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  42.41 
 
 
1287 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.08 
 
 
980 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.5 
 
 
1963 aa  139  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  46.23 
 
 
5171 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  37.69 
 
 
2775 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  50 
 
 
850 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  54.84 
 
 
260 aa  137  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  46.19 
 
 
982 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  40.23 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  47 
 
 
3954 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  41.41 
 
 
2145 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  46 
 
 
615 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  48.11 
 
 
589 aa  133  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  38.83 
 
 
4687 aa  133  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  44.02 
 
 
757 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  39.51 
 
 
795 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  41.87 
 
 
1532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  51.14 
 
 
243 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  44.3 
 
 
4334 aa  130  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  46.07 
 
 
595 aa  130  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  46.6 
 
 
2954 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  35.33 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  38.41 
 
 
3209 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  44.8 
 
 
3608 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.48 
 
 
1016 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.94 
 
 
1363 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  42.51 
 
 
917 aa  127  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  51.2 
 
 
421 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  42.29 
 
 
2885 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  35.07 
 
 
357 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  35.33 
 
 
1079 aa  124  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  45.45 
 
 
950 aa  123  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  44.66 
 
 
526 aa  123  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  39.85 
 
 
648 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  43.42 
 
 
1855 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  45.15 
 
 
2689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.22 
 
 
387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  44.8 
 
 
727 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  37.78 
 
 
1037 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.17 
 
 
2678 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  43.88 
 
 
824 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  46.07 
 
 
686 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  40 
 
 
1346 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  42.44 
 
 
313 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
9867 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  46.01 
 
 
1400 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  45.13 
 
 
606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  36.72 
 
 
741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  37.11 
 
 
734 aa  118  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.86 
 
 
280 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  46.91 
 
 
341 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  42.67 
 
 
1043 aa  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.36 
 
 
280 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  47.27 
 
 
245 aa  117  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  40.09 
 
 
475 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  49.02 
 
 
867 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  32.11 
 
 
2567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  55.47 
 
 
202 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  50.34 
 
 
686 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  55.47 
 
 
202 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  35.74 
 
 
2911 aa  115  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  40.71 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.95 
 
 
547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  45.81 
 
 
460 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  37.78 
 
 
639 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  35.64 
 
 
327 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  38.4 
 
 
820 aa  114  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
303 aa  114  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  48.1 
 
 
938 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  35.58 
 
 
395 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  44.5 
 
 
613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  36.46 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>