More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2055 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 652 aa  1271    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  54.55 
 
 		 709 aa  204  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  37.91 
 
 		 1017 aa  194  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  49.55 
 
 		 1022 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.64 
 
 		 1372 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  48.75 
 
 		 1175 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  51.43 
 
 		 3427 aa  183  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50.54 
 
 		 547 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  45.54 
 
 		 1346 aa  146  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  45.91 
 
 		 813 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.29 
 
 		 588 aa  144  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  38.93 
 
 		 1055 aa  137  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 		 917 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.58 
 
 		 1019 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  42.16 
 
 		 1037 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.57 
 
 		 2678 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.56 
 
 		 1180 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  51.61 
 
 		 1164 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  32.64 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  32.64 
 
 		 395 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  29.13 
 
 		 819 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  39.57 
 
 		 556 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  47.9 
 
 		 2667 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  40.61 
 
 		 1895 aa  94  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  26.65 
 
 		 479 aa  94  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  38.12 
 
 		 327 aa  93.6  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  44.38 
 
 		 202 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  44.38 
 
 		 202 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  48.09 
 
 		 303 aa  93.2  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.8 
 
 		 2346 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  43.84 
 
 		 3619 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  43.84 
 
 		 3619 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  51.89 
 
 		 4798 aa  87.4  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.37 
 
 		 1415 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  46.72 
 
 		 518 aa  87  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  41.54 
 
 		 2885 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  44.37 
 
 		 757 aa  86.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  44.06 
 
 		 219 aa  86.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  43.02 
 
 		 260 aa  85.5  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.55 
 
 		 1197 aa  85.5  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003092  hypothetical protein  39.09 
 
 		 236 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0245591  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  48.15 
 
 		 4106 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  40.31 
 
 		 507 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  43.33 
 
 		 606 aa  84.3  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02754  hypothetical protein  35.83 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.57 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  43.15 
 
 		 938 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  48.65 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  36.22 
 
 		 615 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  39.74 
 
 		 1156 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  50 
 
 		 1499 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.54 
 
 		 1236 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  30.4 
 
 		 546 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  44.62 
 
 		 946 aa  82.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  42.48 
 
 		 2954 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  51 
 
 		 4687 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.04 
 
 		 4836 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  41.61 
 
 		 709 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  39.42 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  36.16 
 
 		 686 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  39.2 
 
 		 833 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.58 
 
 		 1553 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  45.31 
 
 		 686 aa  80.9  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45.61 
 
 		 1424 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  37.42 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.46 
 
 		 1016 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  48.94 
 
 		 1594 aa  80.9  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  40.27 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  40.76 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.31 
 
 		 1795 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  39.6 
 
 		 1544 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  46.79 
 
 		 950 aa  80.5  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.57 
 
 		 5839 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  33.79 
 
 		 357 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 795 aa  80.5  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.52 
 
 		 1963 aa  80.5  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  49.54 
 
 		 2105 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  37.34 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  50.54 
 
 		 833 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  37.35 
 
 		 850 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  31.27 
 
 		 1029 aa  79  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  37.42 
 
 		 5171 aa  79  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  41.43 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.27 
 
 		 1029 aa  79  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  44.53 
 
 		 982 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  49.53 
 
 		 589 aa  78.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  46.38 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.43 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.31 
 
 		 2067 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  43.86 
 
 		 1526 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  46.61 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.58 
 
 		 980 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  46.08 
 
 		 729 aa  77.4  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  40.27 
 
 		 585 aa  77.4  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  47.75 
 
 		 2704 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.7 
 
 		 9867 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1699 aa  76.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  48.21 
 
 		 1814 aa  76.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  38.26 
 
 		 1279 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>