More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4725 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  100 
 
 		 1037 aa  1949    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.34 
 
 		 1180 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.33 
 
 		 1009 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.37 
 
 		 1340 aa  260  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.52 
 
 		 1012 aa  260  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.36 
 
 		 2194 aa  254  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.92 
 
 		 1113 aa  248  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.33 
 
 		 1118 aa  247  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.86 
 
 		 1800 aa  246  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.11 
 
 		 1225 aa  246  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.54 
 
 		 889 aa  243  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.44 
 
 		 1222 aa  240  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  51.88 
 
 		 2310 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  52.34 
 
 		 2305 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.72 
 
 		 768 aa  207  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.59 
 
 		 1269 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.26 
 
 		 928 aa  206  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.98 
 
 		 891 aa  204  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.29 
 
 		 1269 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.9 
 
 		 1029 aa  196  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  33.71 
 
 		 1029 aa  194  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.44 
 
 		 1661 aa  184  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.04 
 
 		 1019 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.58 
 
 		 1415 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  45.35 
 
 		 1055 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  43.02 
 
 		 813 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  37.5 
 
 		 5899 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  45.83 
 
 		 917 aa  148  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  39.93 
 
 		 395 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  39.2 
 
 		 395 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  38.21 
 
 		 709 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.2 
 
 		 547 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.54 
 
 		 3168 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  42.16 
 
 		 652 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  37.2 
 
 		 1175 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.88 
 
 		 3427 aa  121  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.78 
 
 		 588 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.54 
 
 		 3396 aa  109  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.62 
 
 		 255 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  36.07 
 
 		 1017 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  36.07 
 
 		 1022 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  36.24 
 
 		 2192 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.42 
 
 		 767 aa  104  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  34.85 
 
 		 4013 aa  104  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  32.05 
 
 		 8871 aa  104  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.52 
 
 		 1372 aa  101  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.6 
 
 		 3209 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 		 503 aa  98.2  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  35.27 
 
 		 907 aa  98.2  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.06 
 
 		 759 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  38.92 
 
 		 2796 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  36.97 
 
 		 2160 aa  95.5  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  33.11 
 
 		 2198 aa  94  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  32.28 
 
 		 462 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  33.45 
 
 		 2133 aa  93.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  32.62 
 
 		 503 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  38.16 
 
 		 1346 aa  92  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  36.06 
 
 		 768 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  41.53 
 
 		 1134 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.44 
 
 		 2954 aa  90.9  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  31.65 
 
 		 483 aa  90.5  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  40.51 
 
 		 3954 aa  89.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.4 
 
 		 647 aa  90.1  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  43.51 
 
 		 480 aa  88.2  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  36.36 
 
 		 504 aa  86.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  39.26 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  33.94 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  41.98 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  39.01 
 
 		 476 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  34.78 
 
 		 2467 aa  84.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  38.3 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  38.65 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  32.09 
 
 		 1072 aa  82  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  29.13 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  41.98 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33.19 
 
 		 2042 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.63 
 
 		 2346 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  35 
 
 		 786 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  39.25 
 
 		 1764 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  35.91 
 
 		 468 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  41.98 
 
 		 479 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  35.58 
 
 		 2807 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  39.47 
 
 		 759 aa  79.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.99 
 
 		 1145 aa  79.7  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  35.05 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.45 
 
 		 2667 aa  79  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  29.56 
 
 		 2127 aa  78.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.74 
 
 		 1279 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  37.02 
 
 		 535 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  51.76 
 
 		 6753 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  37.13 
 
 		 478 aa  77.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.45 
 
 		 1236 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  42.06 
 
 		 894 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  35.48 
 
 		 7149 aa  77  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  39.47 
 
 		 727 aa  76.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  36.28 
 
 		 1053 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  37.07 
 
 		 1855 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  36.59 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  34.5 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  40.88 
 
 		 4334 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>