More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0424 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  87 
 
 
1022 aa  1789    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
1017 aa  2061    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  53.28 
 
 
1175 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  37.91 
 
 
652 aa  194  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  46.77 
 
 
813 aa  178  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.57 
 
 
3427 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  46.26 
 
 
709 aa  158  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.4 
 
 
588 aa  144  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  40.54 
 
 
917 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.33 
 
 
547 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  41.57 
 
 
938 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.42 
 
 
1019 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  39.01 
 
 
940 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  39.71 
 
 
1346 aa  130  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.83 
 
 
1372 aa  129  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  33.77 
 
 
1055 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  37.5 
 
 
337 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 
327 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.07 
 
 
1037 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  45.64 
 
 
2885 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  33.62 
 
 
460 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.97 
 
 
1236 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.76 
 
 
2678 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  44.3 
 
 
2667 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  47.4 
 
 
202 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  47.4 
 
 
202 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.85 
 
 
1963 aa  104  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  46.21 
 
 
1712 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  43.59 
 
 
1164 aa  103  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.82 
 
 
1180 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  52.68 
 
 
1424 aa  102  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  34.71 
 
 
686 aa  101  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  45.89 
 
 
1197 aa  101  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  37.56 
 
 
615 aa  101  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  36.17 
 
 
260 aa  101  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.1 
 
 
2105 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  31.61 
 
 
395 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  46.76 
 
 
556 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
3954 aa  99.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  45.71 
 
 
867 aa  99.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.86 
 
 
980 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  41.61 
 
 
795 aa  99  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 
709 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  38.19 
 
 
3193 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  39.11 
 
 
395 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.62 
 
 
1795 aa  99  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  36.14 
 
 
1156 aa  98.2  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  37.91 
 
 
12741 aa  98.6  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.04 
 
 
2346 aa  98.2  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.52 
 
 
946 aa  98.2  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  34.19 
 
 
8871 aa  96.3  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  36.74 
 
 
3619 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  40.76 
 
 
303 aa  95.9  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.15 
 
 
9867 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.28 
 
 
3619 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  38.2 
 
 
606 aa  95.5  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  32.65 
 
 
922 aa  95.5  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  31.68 
 
 
1499 aa  95.1  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  36.89 
 
 
1895 aa  94.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  35.37 
 
 
8980 aa  94  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  47.32 
 
 
679 aa  93.6  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  37.63 
 
 
424 aa  93.6  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  37.25 
 
 
4334 aa  93.6  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
572 aa  92.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  35.67 
 
 
2461 aa  91.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.75 
 
 
280 aa  90.5  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  41.33 
 
 
724 aa  90.9  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  36.94 
 
 
4798 aa  90.5  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  42.36 
 
 
219 aa  90.9  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  49.12 
 
 
833 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  33.33 
 
 
2775 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  43.4 
 
 
5171 aa  90.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  39.23 
 
 
2145 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  46.09 
 
 
582 aa  89.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  50.47 
 
 
518 aa  89.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  31.25 
 
 
4465 aa  89  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.65 
 
 
421 aa  89  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  46.43 
 
 
585 aa  89  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.89 
 
 
3363 aa  88.6  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  32.39 
 
 
460 aa  89  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.03 
 
 
280 aa  88.6  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  47.06 
 
 
475 aa  88.6  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  35.93 
 
 
1532 aa  88.6  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  52.69 
 
 
1594 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  34.57 
 
 
1072 aa  88.2  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.88 
 
 
1016 aa  87.8  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  50 
 
 
475 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.77 
 
 
2668 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  33.33 
 
 
959 aa  87  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 
4687 aa  86.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.84 
 
 
1838 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.49 
 
 
1480 aa  86.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  38.46 
 
 
4106 aa  85.5  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  35.94 
 
 
734 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.35 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  42.64 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  39.24 
 
 
2954 aa  85.1  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  31.95 
 
 
595 aa  84.7  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 
467 aa  84  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  36.93 
 
 
686 aa  84.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>