More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1708 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
395 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  98.23 
 
 
395 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  47.98 
 
 
2954 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.43 
 
 
1415 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  50.78 
 
 
2133 aa  262  8.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  46.93 
 
 
2198 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  45.55 
 
 
3209 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  54.64 
 
 
2807 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  49.02 
 
 
2467 aa  242  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  41.36 
 
 
907 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  48.97 
 
 
768 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  47.27 
 
 
851 aa  225  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  45.35 
 
 
3954 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  46.25 
 
 
1764 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  42.65 
 
 
1029 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.65 
 
 
1029 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  46.45 
 
 
1134 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  47.27 
 
 
1133 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.49 
 
 
4334 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  39.94 
 
 
1055 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  39.14 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.1 
 
 
1019 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  43.45 
 
 
3608 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  37.01 
 
 
1610 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.89 
 
 
1197 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  36.75 
 
 
503 aa  155  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  36.01 
 
 
503 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  49.11 
 
 
1855 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.52 
 
 
1180 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  42.81 
 
 
3619 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  43.1 
 
 
3619 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  40.29 
 
 
820 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  38.04 
 
 
574 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  39.93 
 
 
1037 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  40.23 
 
 
2097 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  40.52 
 
 
2950 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  32.89 
 
 
448 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  40.18 
 
 
917 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  48.72 
 
 
1534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  40.19 
 
 
3026 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  38.52 
 
 
546 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  35.78 
 
 
824 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  47.8 
 
 
1532 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  41 
 
 
467 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  32.33 
 
 
1610 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  50 
 
 
727 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  35.52 
 
 
1582 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  45.34 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  45.34 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.5 
 
 
1390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.7 
 
 
2911 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4916  hemolysin-type calcium-binding region  31.72 
 
 
452 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.58 
 
 
588 aa  113  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  40.2 
 
 
621 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  39.2 
 
 
2701 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.24 
 
 
547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  33.45 
 
 
709 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  33.45 
 
 
1557 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.27 
 
 
3427 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  34.8 
 
 
1022 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  34.23 
 
 
1628 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  35.51 
 
 
1544 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  36.33 
 
 
1175 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  31.61 
 
 
1017 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  32.64 
 
 
652 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  37.35 
 
 
540 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  36.95 
 
 
540 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.77 
 
 
1145 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  34.84 
 
 
614 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.85 
 
 
1079 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.4 
 
 
2678 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  40.69 
 
 
1346 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  29.85 
 
 
556 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  33.67 
 
 
1213 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  33.47 
 
 
531 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  33.06 
 
 
531 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  43.32 
 
 
1650 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  31.84 
 
 
1112 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  32.16 
 
 
2567 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.6 
 
 
1236 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  30.91 
 
 
535 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.61 
 
 
833 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  31.64 
 
 
535 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  32.57 
 
 
1164 aa  83.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  30.29 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  32.32 
 
 
2145 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
946 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  29.22 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  33.85 
 
 
759 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 
2885 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  39.02 
 
 
486 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33 
 
 
813 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  33.12 
 
 
1712 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  33.22 
 
 
2836 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.34 
 
 
2775 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  28.97 
 
 
1072 aa  80.1  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.36 
 
 
1372 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  32.09 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  32.09 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
965 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>