More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0627 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  100 
 
 
606 aa  1183    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  44.38 
 
 
861 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  53.73 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  40.26 
 
 
641 aa  201  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  48.33 
 
 
686 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  46.77 
 
 
385 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  44.89 
 
 
375 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  31.14 
 
 
727 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.85 
 
 
820 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  32.4 
 
 
490 aa  144  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  34.99 
 
 
476 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  40.91 
 
 
785 aa  138  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  32.58 
 
 
474 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  33.99 
 
 
478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  32.39 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.96 
 
 
2105 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  37.45 
 
 
686 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  33.87 
 
 
504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  27.69 
 
 
648 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  38.46 
 
 
1164 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  32.02 
 
 
476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  38.64 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  39.86 
 
 
3619 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  41.45 
 
 
2667 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.81 
 
 
1236 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  33.42 
 
 
486 aa  127  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.5 
 
 
3619 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  31.33 
 
 
480 aa  126  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  28.98 
 
 
1134 aa  126  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  51.52 
 
 
946 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  38.24 
 
 
481 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  29.36 
 
 
1133 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  43.81 
 
 
709 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.94 
 
 
3427 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  47.22 
 
 
2885 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  32.1 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.33 
 
 
1795 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  42.5 
 
 
491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  43.35 
 
 
1400 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  32.78 
 
 
615 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  32.3 
 
 
468 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  36.96 
 
 
460 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  41.38 
 
 
813 aa  120  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  30.35 
 
 
535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.07 
 
 
1712 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.13 
 
 
588 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  29.5 
 
 
535 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  40.91 
 
 
1079 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  45.3 
 
 
260 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.78 
 
 
980 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.49 
 
 
2775 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  40.18 
 
 
1895 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  46.54 
 
 
613 aa  117  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
1287 aa  117  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.23 
 
 
1424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  37.05 
 
 
451 aa  115  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  42.93 
 
 
2954 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  29.6 
 
 
1112 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.8 
 
 
1016 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  30.3 
 
 
531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  44.9 
 
 
361 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  45.95 
 
 
4687 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  44.9 
 
 
361 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  39.78 
 
 
2145 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  44.77 
 
 
639 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  43 
 
 
950 aa  110  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  34.35 
 
 
531 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.74 
 
 
3954 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  44.3 
 
 
833 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  44.09 
 
 
4800 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.64 
 
 
2668 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.33 
 
 
2678 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  43.55 
 
 
757 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.62 
 
 
1279 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.44 
 
 
421 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  40.37 
 
 
679 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  27.74 
 
 
614 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  39.43 
 
 
3608 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  39.88 
 
 
582 aa  108  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  45 
 
 
1175 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  40.87 
 
 
526 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  44.81 
 
 
1363 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  43.55 
 
 
361 aa  107  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  49.09 
 
 
518 aa  107  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.9 
 
 
938 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  39.29 
 
 
585 aa  107  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  43.5 
 
 
202 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  41.71 
 
 
572 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  42.22 
 
 
734 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  43.5 
 
 
202 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  37.19 
 
 
589 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  44.2 
 
 
4334 aa  106  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.1 
 
 
1963 aa  106  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 
982 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 
341 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  39.9 
 
 
965 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  46.3 
 
 
327 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  39.11 
 
 
1197 aa  104  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
741 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  36.57 
 
 
5171 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>