More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2710 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
327 aa  611  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  47.92 
 
 
2145 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  43.41 
 
 
795 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  39.46 
 
 
1287 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  44.75 
 
 
946 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  45.09 
 
 
491 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.6 
 
 
980 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.64 
 
 
588 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  45.71 
 
 
595 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.13 
 
 
1795 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  43.96 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  45.21 
 
 
1363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.11 
 
 
3427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  36.33 
 
 
639 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 
1017 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  46.33 
 
 
2105 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.52 
 
 
4334 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 
1022 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40 
 
 
1279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  39.25 
 
 
1175 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 
982 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  41.03 
 
 
460 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  44.65 
 
 
361 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  37.55 
 
 
5171 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  44.65 
 
 
361 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  41.14 
 
 
2954 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  49.66 
 
 
280 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.64 
 
 
1424 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  49.66 
 
 
280 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  42.42 
 
 
1712 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  40.23 
 
 
613 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 
361 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  34.2 
 
 
813 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  39.35 
 
 
615 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.63 
 
 
1164 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.05 
 
 
2667 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  46.3 
 
 
606 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.43 
 
 
1963 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  41.95 
 
 
717 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  33.92 
 
 
357 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  42.78 
 
 
757 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  41.21 
 
 
1532 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  38.8 
 
 
243 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  45.83 
 
 
2885 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  49.66 
 
 
2775 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  36.36 
 
 
833 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
1895 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  47.19 
 
 
741 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  38.68 
 
 
1079 aa  99.4  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.52 
 
 
1534 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  42.46 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  41.81 
 
 
526 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  37.77 
 
 
9867 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  32.67 
 
 
1055 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  38.26 
 
 
424 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  33.68 
 
 
437 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  45.58 
 
 
219 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  45.57 
 
 
950 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  37.3 
 
 
589 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  45.12 
 
 
734 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  39.56 
 
 
709 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  41.94 
 
 
1400 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  33.99 
 
 
437 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  40.88 
 
 
453 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.95 
 
 
219 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
1236 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  45.12 
 
 
4687 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.12 
 
 
3954 aa  96.3  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  43.68 
 
 
1544 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 
232 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  41.29 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  46.98 
 
 
3619 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.98 
 
 
3619 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.47 
 
 
2668 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  46.28 
 
 
460 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  40 
 
 
709 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  42.44 
 
 
729 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.24 
 
 
421 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.25 
 
 
1016 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  39.18 
 
 
686 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  38.12 
 
 
652 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  36.61 
 
 
257 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 
385 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.44 
 
 
2678 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  37.33 
 
 
387 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  39.3 
 
 
2689 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  37.1 
 
 
1883 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.45 
 
 
1019 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2816  hemolysin-type calcium-binding region  36.29 
 
 
351 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  33.11 
 
 
393 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  43.36 
 
 
572 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  37.56 
 
 
724 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  49.22 
 
 
518 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.44 
 
 
556 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  40 
 
 
820 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  41.38 
 
 
728 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  43.17 
 
 
769 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  34.77 
 
 
965 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  46.31 
 
 
202 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  35.9 
 
 
679 aa  89.7  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>