More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5060 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 396 aa  728    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  72.99 
 
 		 387 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  70.65 
 
 		 387 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 		 946 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.28 
 
 		 1279 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 		 526 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.24 
 
 		 1164 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  42.28 
 
 		 1400 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  39.68 
 
 		 595 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.12 
 
 		 2667 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.82 
 
 		 1795 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  36.32 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  45.61 
 
 		 2954 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  37.5 
 
 		 613 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.69 
 
 		 1363 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  40.69 
 
 		 833 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.17 
 
 		 3427 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1424 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  41.74 
 
 		 1534 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.08 
 
 		 980 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  35.26 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  39.95 
 
 		 2105 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  35.75 
 
 		 491 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  39.71 
 
 		 4334 aa  142  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.65 
 
 		 2689 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.12 
 
 		 3954 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  37.27 
 
 		 1532 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  38.44 
 
 		 3619 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  36.55 
 
 		 460 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34.53 
 
 		 9867 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  42.02 
 
 		 1287 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  30.41 
 
 		 3209 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.95 
 
 		 1895 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  39.56 
 
 		 965 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  37.74 
 
 		 2911 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  36.86 
 
 		 341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  39.3 
 
 		 4800 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  36.48 
 
 		 1156 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.22 
 
 		 1236 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  41.81 
 
 		 824 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  40.51 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  38.87 
 
 		 1855 aa  126  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  39.75 
 
 		 1499 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  37.28 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  36.99 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 		 982 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  36.53 
 
 		 518 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.75 
 
 		 3619 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  46.88 
 
 		 589 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  35.58 
 
 		 2145 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  33.87 
 
 		 1884 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.66 
 
 		 2775 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  38.87 
 
 		 850 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.98 
 
 		 1079 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.01 
 
 		 2678 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.22 
 
 		 2668 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  43.64 
 
 		 561 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.56 
 
 		 820 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  36.68 
 
 		 516 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  37.72 
 
 		 3608 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.98 
 
 		 556 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.45 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  39.1 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 795 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 		 686 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  40.25 
 
 		 260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  34.96 
 
 		 860 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.3 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  35.1 
 
 		 615 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  36.39 
 
 		 1043 aa  109  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  35.1 
 
 		 1544 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  33.08 
 
 		 589 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  38.6 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  31.4 
 
 		 959 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  41.35 
 
 		 4687 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.43 
 
 		 1197 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  47.26 
 
 		 686 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  38.28 
 
 		 2885 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  41.62 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  39.9 
 
 		 245 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  38.46 
 
 		 942 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  33.51 
 
 		 745 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.83 
 
 		 813 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  31.86 
 
 		 2467 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  36.74 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.71 
 
 		 1016 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  41.63 
 
 		 950 aa  99.8  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  35.28 
 
 		 2836 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  35.96 
 
 		 769 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  39.18 
 
 		 1712 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  40.64 
 
 		 219 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  34.08 
 
 		 3598 aa  96.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  34.24 
 
 		 855 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.18 
 
 		 1963 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  35.11 
 
 		 4798 aa  95.9  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  40.74 
 
 		 938 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  41.28 
 
 		 606 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>