More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3074 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  43.64 
 
 		 1156 aa  638    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  100 
 
 		 855 aa  1640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  42.98 
 
 		 1499 aa  535  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  41.67 
 
 		 1480 aa  533  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  36.62 
 
 		 2954 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  37.01 
 
 		 2107 aa  349  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  34.18 
 
 		 3598 aa  349  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  33.74 
 
 		 1814 aa  309  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  34.42 
 
 		 4798 aa  297  7e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.54 
 
 		 1607 aa  283  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.9 
 
 		 1789 aa  280  9e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  47.67 
 
 		 999 aa  273  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  30.85 
 
 		 2245 aa  263  1e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  29.05 
 
 		 3209 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  29.11 
 
 		 1217 aa  241  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  29.6 
 
 		 860 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  32.56 
 
 		 2911 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 1925 aa  196  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  35.52 
 
 		 946 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1306 aa  191  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  30.73 
 
 		 1168 aa  187  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.37 
 
 		 1079 aa  184  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.24 
 
 		 1279 aa  181  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.66 
 
 		 4334 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.06 
 
 		 2689 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.63 
 
 		 1400 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.67 
 
 		 3954 aa  170  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.64 
 
 		 1102 aa  167  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 1383 aa  165  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.79 
 
 		 1180 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  38.93 
 
 		 959 aa  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  31.4 
 
 		 942 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  31.67 
 
 		 1197 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  32.08 
 
 		 1112 aa  153  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 2678 aa  148  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  30.75 
 
 		 928 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.53 
 
 		 1363 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.06 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  31.46 
 
 		 1855 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.74 
 
 		 824 aa  140  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  47.24 
 
 		 1532 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  31.54 
 
 		 1884 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  46.63 
 
 		 1534 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  33.55 
 
 		 4800 aa  138  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  31.38 
 
 		 932 aa  138  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  29.02 
 
 		 1582 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  31.94 
 
 		 965 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  32.94 
 
 		 1421 aa  134  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  29.21 
 
 		 928 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  33.87 
 
 		 1839 aa  132  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  30.72 
 
 		 1164 aa  130  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.95 
 
 		 2775 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  30.02 
 
 		 2097 aa  127  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.2 
 
 		 2667 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  28.81 
 
 		 2836 aa  124  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  29.44 
 
 		 4723 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.29 
 
 		 980 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 		 475 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.78 
 
 		 595 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  29.67 
 
 		 1145 aa  121  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  29 
 
 		 3026 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.9 
 
 		 1403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  31.74 
 
 		 475 aa  118  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2509  Hemolysin-type calcium binding domain protein  30.65 
 
 		 352 aa  118  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70233  normal  0.227356 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  37.89 
 
 		 341 aa  118  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  31.49 
 
 		 856 aa  118  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.03 
 
 		 998 aa  118  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  29.59 
 
 		 998 aa  117  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  32.33 
 
 		 518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.26 
 
 		 5769 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  28.73 
 
 		 2467 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.62 
 
 		 1236 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.29 
 
 		 2105 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.64 
 
 		 4687 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.98 
 
 		 820 aa  112  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  36.16 
 
 		 460 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  36.62 
 
 		 363 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  37.22 
 
 		 341 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  37.09 
 
 		 329 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  37.09 
 
 		 329 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  40.08 
 
 		 313 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.44 
 
 		 387 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  31.97 
 
 		 1895 aa  110  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  31.29 
 
 		 889 aa  108  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  34.91 
 
 		 460 aa  108  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  28.54 
 
 		 2950 aa  108  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  35.83 
 
 		 437 aa  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  29.18 
 
 		 515 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  27.22 
 
 		 1864 aa  104  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  29.15 
 
 		 1544 aa  104  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.54 
 
 		 1415 aa  104  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  32.42 
 
 		 3608 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  34.86 
 
 		 357 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  34.08 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  34.74 
 
 		 613 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  41.8 
 
 		 833 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  33.11 
 
 		 874 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  33.23 
 
 		 485 aa  103  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.75 
 
 		 1019 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>