100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6773 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  100 
 
 		 1925 aa  3798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  27.59 
 
 		 3209 aa  319  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.08 
 
 		 1156 aa  271  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  24.62 
 
 		 1480 aa  244  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  26.42 
 
 		 2954 aa  233  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  27.08 
 
 		 3598 aa  231  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1306 aa  228  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  29.05 
 
 		 1499 aa  213  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.04 
 
 		 855 aa  203  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 2107 aa  199  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  27.06 
 
 		 1217 aa  181  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  24.13 
 
 		 2245 aa  167  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  25.28 
 
 		 999 aa  162  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  26.38 
 
 		 1789 aa  159  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  57.04 
 
 		 337 aa  157  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  25.72 
 
 		 1814 aa  156  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  32.11 
 
 		 541 aa  148  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  35.42 
 
 		 940 aa  147  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  32.66 
 
 		 844 aa  141  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  31.99 
 
 		 4798 aa  139  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  33.7 
 
 		 959 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  35.02 
 
 		 679 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.81 
 
 		 1607 aa  127  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  32.37 
 
 		 1112 aa  125  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  37.86 
 
 		 428 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  25.82 
 
 		 1168 aa  110  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  32.22 
 
 		 4687 aa  109  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  36.84 
 
 		 960 aa  109  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  33.82 
 
 		 928 aa  109  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  35.67 
 
 		 618 aa  105  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  24.68 
 
 		 860 aa  99  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  34.15 
 
 		 2767 aa  97.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  37.35 
 
 		 1809 aa  97.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  38.04 
 
 		 1805 aa  97.1  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  45.67 
 
 		 548 aa  96.3  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  40.58 
 
 		 466 aa  95.1  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  37.24 
 
 		 585 aa  93.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  45.24 
 
 		 351 aa  92  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  35.17 
 
 		 582 aa  90.5  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 1102 aa  87  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 		 2296 aa  85.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.05 
 
 		 2911 aa  83.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  35.4 
 
 		 371 aa  81.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2509  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.96 
 
 		 352 aa  80.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70233  normal  0.227356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  37.95 
 
 		 2682 aa  79  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  42.74 
 
 		 359 aa  78.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6671  hypothetical protein  34.64 
 
 		 755 aa  78.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538949  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  39.45 
 
 		 677 aa  75.5  0.000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  39.45 
 
 		 532 aa  75.1  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  32.14 
 
 		 2113 aa  74.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  36.09 
 
 		 435 aa  74.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  38.1 
 
 		 435 aa  73.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  40.74 
 
 		 320 aa  73.9  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  35.67 
 
 		 295 aa  73.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0384  hypothetical protein  35.14 
 
 		 355 aa  72  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.94 
 
 		 1534 aa  72  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  31.85 
 
 		 326 aa  71.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  30.95 
 
 		 1532 aa  71.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  28.92 
 
 		 346 aa  70.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  37.4 
 
 		 354 aa  70.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.03 
 
 		 1180 aa  70.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  31.1 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  23.59 
 
 		 2689 aa  68.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  35.29 
 
 		 1544 aa  68.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  31.29 
 
 		 345 aa  67.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  30.91 
 
 		 351 aa  68.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  34.13 
 
 		 422 aa  68.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  33.33 
 
 		 788 aa  67  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  38 
 
 		 327 aa  66.6  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  32.59 
 
 		 1383 aa  64.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  36.36 
 
 		 310 aa  63.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  27.74 
 
 		 1400 aa  61.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  24.23 
 
 		 1864 aa  58.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  26.06 
 
 		 1403 aa  57.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  28.36 
 
 		 1839 aa  57.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0380  hypothetical protein  27.74 
 
 		 308 aa  56.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  41.67 
 
 		 435 aa  55.5  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  27.76 
 
 		 998 aa  53.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  24.69 
 
 		 2775 aa  51.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  30.08 
 
 		 2342 aa  51.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  30.08 
 
 		 2342 aa  51.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  29.91 
 
 		 2667 aa  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.94 
 
 		 1236 aa  49.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 475 aa  49.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 		 467 aa  49.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  28.7 
 
 		 1712 aa  47.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2686  lipase, class 3  28.44 
 
 		 617 aa  47.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.458877  unclonable  0.0000292693 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  28.57 
 
 		 648 aa  47.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  26.59 
 
 		 692 aa  47.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  26.07 
 
 		 889 aa  47.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  26 
 
 		 998 aa  47.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  29.19 
 
 		 475 aa  47  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  41.94 
 
 		 2885 aa  47  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.77 
 
 		 3026 aa  46.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4067  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1442 aa  46.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.715218  normal  0.232276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.67 
 
 		 219 aa  46.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  25.97 
 
 		 1029 aa  45.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.97 
 
 		 1029 aa  46.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  36.14 
 
 		 265 aa  45.8  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  36.56 
 
 		 757 aa  45.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>