More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51170 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  49.24 
 
 		 1610 aa  803    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  49.95 
 
 		 1610 aa  813    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  78.11 
 
 		 553 aa  779    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  61.34 
 
 		 856 aa  949    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  84.65 
 
 		 1403 aa  2212    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  82.01 
 
 		 998 aa  1534    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  85.04 
 
 		 998 aa  1600    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  100 
 
 		 1839 aa  3575    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  63.9 
 
 		 874 aa  994    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  66.1 
 
 		 532 aa  633  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  48.73 
 
 		 1168 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  57.52 
 
 		 889 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  57.17 
 
 		 901 aa  452  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  55.97 
 
 		 858 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  44.55 
 
 		 515 aa  321  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  42.24 
 
 		 495 aa  246  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.37 
 
 		 1180 aa  207  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  44.73 
 
 		 340 aa  204  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  30.23 
 
 		 1480 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.51 
 
 		 1079 aa  134  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.87 
 
 		 855 aa  132  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  30.92 
 
 		 3209 aa  126  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  28.94 
 
 		 1499 aa  122  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.65 
 
 		 1156 aa  121  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  32.19 
 
 		 946 aa  115  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33.27 
 
 		 2911 aa  114  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  34.93 
 
 		 2954 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30.26 
 
 		 3598 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  40 
 
 		 1055 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  29.86 
 
 		 3954 aa  110  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.4 
 
 		 1019 aa  109  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.18 
 
 		 4334 aa  108  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  32.98 
 
 		 518 aa  109  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  32.37 
 
 		 503 aa  106  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  32.14 
 
 		 503 aa  105  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  28.24 
 
 		 1532 aa  105  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.82 
 
 		 2689 aa  102  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  33.77 
 
 		 1855 aa  102  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.59 
 
 		 1534 aa  102  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  34.98 
 
 		 462 aa  101  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28.84 
 
 		 3026 aa  101  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.51 
 
 		 2467 aa  100  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  30.5 
 
 		 1164 aa  99.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.65 
 
 		 5769 aa  97.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  36 
 
 		 214 aa  95.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.62 
 
 		 2775 aa  95.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  29.51 
 
 		 2133 aa  95.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  30.14 
 
 		 4798 aa  94  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.69 
 
 		 2807 aa  94  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.98 
 
 		 1145 aa  93.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.33 
 
 		 2678 aa  92.8  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  30.22 
 
 		 3608 aa  92.8  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.16 
 
 		 2245 aa  92.8  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  32.38 
 
 		 648 aa  92  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  31.79 
 
 		 820 aa  92  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  30.65 
 
 		 1544 aa  90.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.92 
 
 		 621 aa  90.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  32.92 
 
 		 621 aa  90.1  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  28.92 
 
 		 2198 aa  89.4  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  32.09 
 
 		 556 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  33.33 
 
 		 999 aa  88.6  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  30.31 
 
 		 928 aa  87.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 329 aa  88.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.81 
 
 		 1279 aa  87.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 329 aa  88.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.18 
 
 		 3619 aa  87.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  33.99 
 
 		 3619 aa  87  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  29.43 
 
 		 1884 aa  86.7  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  27.37 
 
 		 1197 aa  86.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  30.09 
 
 		 824 aa  85.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  30.6 
 
 		 1814 aa  85.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  29.22 
 
 		 595 aa  85.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  31.16 
 
 		 2836 aa  84.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 2107 aa  84  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.35 
 
 		 4687 aa  83.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  27.98 
 
 		 682 aa  82.8  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  30.61 
 
 		 942 aa  82.8  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  33.58 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  31.3 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  35.98 
 
 		 1883 aa  82  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  29.61 
 
 		 745 aa  82  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.2 
 
 		 2701 aa  81.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  28.37 
 
 		 851 aa  81.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  29.8 
 
 		 932 aa  81.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  32.91 
 
 		 537 aa  80.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  32.73 
 
 		 313 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.29 
 
 		 1400 aa  80.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  31.49 
 
 		 965 aa  79.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  28.97 
 
 		 795 aa  79.7  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  42.36 
 
 		 4106 aa  79.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  31.42 
 
 		 1383 aa  79  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  30.91 
 
 		 4800 aa  78.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.4 
 
 		 1415 aa  77.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.11 
 
 		 588 aa  78.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  33.86 
 
 		 768 aa  76.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  35.66 
 
 		 546 aa  76.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  49.52 
 
 		 2704 aa  76.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  32.62 
 
 		 448 aa  76.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.78 
 
 		 2239 aa  76.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  30.24 
 
 		 606 aa  75.9  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>