More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51200 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  75.61 
 
 		 874 aa  776    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  74.39 
 
 		 998 aa  753    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  100 
 
 		 553 aa  1095    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  78.28 
 
 		 1403 aa  815    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  74.06 
 
 		 998 aa  743    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  78.11 
 
 		 1839 aa  773    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  61.96 
 
 		 856 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  63.3 
 
 		 532 aa  615  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  60.15 
 
 		 1610 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  58.65 
 
 		 1610 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  62.58 
 
 		 1168 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  63.03 
 
 		 889 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  51.26 
 
 		 901 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  67.14 
 
 		 858 aa  170  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  53.15 
 
 		 515 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  54.86 
 
 		 340 aa  127  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  41.56 
 
 		 495 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  39.29 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  43.48 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  44.86 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  44.86 
 
 		 476 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  50.62 
 
 		 1145 aa  71.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  54.88 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  40.15 
 
 		 481 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  49.4 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  39.64 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 759 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  37.25 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  35.44 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  37.41 
 
 		 768 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  54.88 
 
 		 2542 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  50.62 
 
 		 1202 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  43.48 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  51.14 
 
 		 4678 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  29.15 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  51.9 
 
 		 5218 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  48.72 
 
 		 1390 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  37.96 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  51.32 
 
 		 1079 aa  64.7  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  41.9 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.62 
 
 		 2812 aa  64.3  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  45.98 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  43.85 
 
 		 8682 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  41.49 
 
 		 3619 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.49 
 
 		 3619 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  47.73 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1111 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.91 
 
 		 2239 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1121 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  46.43 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.59 
 
 		 3209 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  60.71 
 
 		 475 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.91 
 
 		 6683 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  46.08 
 
 		 5769 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  46.91 
 
 		 6662 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  60.71 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  42.75 
 
 		 9030 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  46.91 
 
 		 6779 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  47.19 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.39 
 
 		 1553 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  45.24 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  43.88 
 
 		 2704 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  46.51 
 
 		 2743 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  44.68 
 
 		 219 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  43.62 
 
 		 833 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  51.22 
 
 		 2097 aa  62  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  45.26 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 		 1073 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  40.43 
 
 		 3608 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  44.74 
 
 		 2567 aa  61.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  49.45 
 
 		 757 aa  60.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.54 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  45.98 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  47.73 
 
 		 2768 aa  60.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.84 
 
 		 5962 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1424 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.58 
 
 		 1052 aa  60.1  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  44.68 
 
 		 1019 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  48.44 
 
 		 1526 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  38.53 
 
 		 547 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  44.32 
 
 		 2701 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.43 
 
 		 5839 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.07 
 
 		 1156 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  33.6 
 
 		 7919 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  42.99 
 
 		 946 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  39.45 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2121  hemolysin-type calcium-binding region  35.95 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190728  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40.43 
 
 		 813 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  62.5 
 
 		 2345 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  43.16 
 
 		 652 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.07 
 
 		 5098 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  59.62 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  32.02 
 
 		 621 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  40.77 
 
 		 6753 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  45.71 
 
 		 1895 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.02 
 
 		 621 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  41.98 
 
 		 2524 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  40.95 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>