52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3618 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1104    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1865  hypothetical protein  40.54 
 
 		 530 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1866  hypothetical protein  39.01 
 
 		 536 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0181178  normal  0.966221 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1973  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.03 
 
 		 365 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2007  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.03 
 
 		 365 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1453  hypothetical protein  24.51 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  39.71 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  28.95 
 
 		 807 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 560 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  31.52 
 
 		 622 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  40.74 
 
 		 559 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  32.35 
 
 		 451 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  29.41 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  37.08 
 
 		 495 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  40.96 
 
 		 781 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  48.68 
 
 		 998 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.28 
 
 		 1839 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  48.68 
 
 		 1403 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  32.2 
 
 		 470 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  34.91 
 
 		 467 aa  51.2  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  48.68 
 
 		 998 aa  50.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  48.68 
 
 		 856 aa  50.4  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  35.21 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  59.52 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  34.67 
 
 		 532 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.61 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  36.63 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  37.88 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  36.44 
 
 		 1610 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  32.14 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  25.88 
 
 		 567 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3656  hypothetical protein  27.16 
 
 		 708 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  37.08 
 
 		 983 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  36.63 
 
 		 460 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.51 
 
 		 582 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  46.51 
 
 		 649 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  31.36 
 
 		 916 aa  47.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0454  hypothetical protein  27.45 
 
 		 408 aa  47  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 		 1380 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  36.78 
 
 		 464 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  36.94 
 
 		 1610 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  35.29 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2626  hypothetical protein  24.76 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.134796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2692  hypothetical protein  31.53 
 
 		 503 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.996294  decreased coverage  0.00255233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  32.38 
 
 		 582 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  27.78 
 
 		 503 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  38.37 
 
 		 1380 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  43.75 
 
 		 541 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3272  hypothetical protein  36.97 
 
 		 533 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.44 
 
 		 874 aa  43.9  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  45.24 
 
 		 475 aa  43.9  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  29.73 
 
 		 524 aa  43.5  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>