16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0432 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  994    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  35.81 
 
 		 622 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1183  hypothetical protein  37.04 
 
 		 632 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  54.17 
 
 		 415 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  50 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  24.91 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  48.98 
 
 		 649 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  39.51 
 
 		 559 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  56.1 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2072  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.33 
 
 		 1003 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.437854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2071  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  51.11 
 
 		 1003 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1560  Parallel beta-helix repeat protein  55.26 
 
 		 832 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.672453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2472  hypothetical protein  28.76 
 
 		 503 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.18 
 
 		 998 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  48.78 
 
 		 518 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0257  hypothetical protein  40.48 
 
 		 692 aa  43.5  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.884266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>