37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2384 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  814    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2286  hypothetical protein  34.36 
 
 		 647 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2412  hypothetical protein  26.04 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  26.44 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  25.32 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.04 
 
 		 582 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  25.79 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4122  hypothetical protein  22.14 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121247  normal  0.360748 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  31.85 
 
 		 807 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  25 
 
 		 916 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  24.17 
 
 		 567 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  54.17 
 
 		 495 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  33.88 
 
 		 1115 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  49.02 
 
 		 518 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1183  hypothetical protein  56.14 
 
 		 632 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  29.41 
 
 		 547 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  45.45 
 
 		 503 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  34.34 
 
 		 622 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4926  hypothetical protein  37.36 
 
 		 541 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388677  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2774  hypothetical protein  33.33 
 
 		 691 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134072  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  53.57 
 
 		 781 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2778  hypothetical protein  41.94 
 
 		 611 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4151  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04825  conserved hypothetical protein  34.52 
 
 		 900 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3991  hypothetical protein  47.06 
 
 		 635 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  36.11 
 
 		 559 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2072  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.61 
 
 		 1003 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.437854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  52.5 
 
 		 606 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0257  hypothetical protein  52.17 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.884266  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.3 
 
 		 998 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  54.55 
 
 		 1839 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  41.38 
 
 		 528 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5350  hypothetical protein  44.23 
 
 		 489 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  44.64 
 
 		 1380 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  52.27 
 
 		 1403 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  52.27 
 
 		 998 aa  43.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  65.22 
 
 		 553 aa  43.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  38.1 
 
 		 496 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0667593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>