21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0826 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  73.53 
 
 
567 aa  662    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  77.11 
 
 
451 aa  710    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  958    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  75.38 
 
 
464 aa  682    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  75.57 
 
 
916 aa  660    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  25.79 
 
 
415 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  23.2 
 
 
807 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  30 
 
 
503 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.33 
 
 
582 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.61 
 
 
998 aa  50.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  32 
 
 
547 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2527  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.63 
 
 
847 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04825  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 
900 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2778  hypothetical protein  36.51 
 
 
611 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  43.75 
 
 
528 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  35.71 
 
 
781 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 
479 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  36.23 
 
 
1380 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487463 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  36.14 
 
 
1380 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  45.65 
 
 
496 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2071  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40 
 
 
1003 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>