17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3592 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3587  hypothetical protein  97.16 
 
 
528 aa  966    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3660  hypothetical protein  97.16 
 
 
528 aa  966    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.805828  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1055    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3586  hypothetical protein  40.35 
 
 
784 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3581  hypothetical protein  39.85 
 
 
791 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3654  hypothetical protein  39.85 
 
 
791 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  22.83 
 
 
509 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  27.49 
 
 
496 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5350  hypothetical protein  30.12 
 
 
489 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  26.85 
 
 
1085 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  24.77 
 
 
807 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  41.38 
 
 
415 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  48.78 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  43.75 
 
 
470 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  43.75 
 
 
451 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  44.44 
 
 
916 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  24.24 
 
 
559 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>