25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3654 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3581  hypothetical protein  100 
 
 
791 aa  1566    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3654  hypothetical protein  100 
 
 
791 aa  1566    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3586  hypothetical protein  96.46 
 
 
784 aa  1397    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3587  hypothetical protein  40.37 
 
 
528 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3660  hypothetical protein  40.37 
 
 
528 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.805828  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  40.37 
 
 
528 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 
606 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  55 
 
 
415 aa  51.6  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  24.77 
 
 
431 aa  51.2  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  27.86 
 
 
420 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  27.5 
 
 
420 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.78 
 
 
998 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  27.5 
 
 
421 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  26.79 
 
 
420 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  27.5 
 
 
421 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  27.5 
 
 
421 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 
649 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  26.43 
 
 
419 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  48.78 
 
 
451 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  48.78 
 
 
470 aa  46.2  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  48.78 
 
 
464 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  48.78 
 
 
916 aa  46.2  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  54.55 
 
 
622 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  45.45 
 
 
807 aa  45.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  36.26 
 
 
496 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0667593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>