20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0833 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  77.25 
 
 		 567 aa  652    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  922    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  77.11 
 
 		 470 aa  710    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  79.25 
 
 		 916 aa  651    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  72.85 
 
 		 464 aa  660    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  26.44 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.23 
 
 		 582 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2527  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.61 
 
 		 847 aa  51.2  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  25.5 
 
 		 807 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.61 
 
 		 998 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  28.24 
 
 		 503 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  30 
 
 		 547 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  37.35 
 
 		 1380 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2778  hypothetical protein  38.1 
 
 		 611 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  43.14 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2071  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.67 
 
 		 1003 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  43.75 
 
 		 528 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  35.71 
 
 		 781 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  36.23 
 
 		 1380 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  36.23 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>