20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4755 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  992    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3905  parallel beta-helix repeat protein  29.27 
 
 		 926 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0449733  normal  0.0115545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2072  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  48.94 
 
 		 1003 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.437854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  40.58 
 
 		 537 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3991  hypothetical protein  57.78 
 
 		 635 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697572 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  44.23 
 
 		 781 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  40.3 
 
 		 1380 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  51.16 
 
 		 622 aa  47  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.93 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  26.9 
 
 		 528 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.93 
 
 		 998 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  25.12 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  43.14 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 		 1380 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  39.13 
 
 		 1236 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2243  nitrous oxidase accessory protein  23.49 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.685019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 479 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.38 
 
 		 582 aa  44.3  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  25.54 
 
 		 677 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6288  hypothetical protein  31.88 
 
 		 397 aa  43.5  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>