100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4349 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  61.41 
 
 		 1206 aa  747    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  100 
 
 		 1236 aa  2508    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  31.75 
 
 		 1302 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  54.29 
 
 		 601 aa  149  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  54.61 
 
 		 1295 aa  147  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  48.59 
 
 		 812 aa  136  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  40.96 
 
 		 970 aa  134  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  46.21 
 
 		 693 aa  134  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  47.3 
 
 		 1193 aa  124  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  38.66 
 
 		 693 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  42.35 
 
 		 1392 aa  121  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  35.95 
 
 		 1479 aa  118  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  42.31 
 
 		 1193 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  42.19 
 
 		 969 aa  116  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  42.18 
 
 		 2334 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  23.97 
 
 		 898 aa  110  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  43.15 
 
 		 1069 aa  109  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  41.22 
 
 		 569 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.71 
 
 		 558 aa  103  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.72 
 
 		 1424 aa  102  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1024 aa  97.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  37.3 
 
 		 2142 aa  97.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.93 
 
 		 766 aa  94.7  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 760 aa  93.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  36.18 
 
 		 1687 aa  86.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  34.87 
 
 		 1465 aa  81.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  35.29 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  36.52 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  42.86 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.54 
 
 		 765 aa  75.1  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  48.68 
 
 		 547 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  44.44 
 
 		 495 aa  70.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0451  sulfatase  33.33 
 
 		 719 aa  70.5  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  39.18 
 
 		 578 aa  69.3  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  41.25 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  28.95 
 
 		 1455 aa  67.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  30.08 
 
 		 682 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.31 
 
 		 496 aa  67  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  39.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  33.33 
 
 		 14944 aa  66.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  41 
 
 		 540 aa  66.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  37.17 
 
 		 694 aa  65.1  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  42.7 
 
 		 1117 aa  65.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  42.7 
 
 		 1117 aa  65.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  23.54 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.5 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1313  hypothetical protein  38.71 
 
 		 451 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.83 
 
 		 790 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.31 
 
 		 496 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  22.2 
 
 		 709 aa  63.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  41.98 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  42.53 
 
 		 687 aa  61.6  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  24.1 
 
 		 918 aa  61.6  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.67 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  41.38 
 
 		 687 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  42.7 
 
 		 1201 aa  58.9  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  42.35 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  21.76 
 
 		 951 aa  58.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.45 
 
 		 1064 aa  57.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  35.71 
 
 		 1119 aa  57  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.46 
 
 		 964 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1808  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  25.52 
 
 		 413 aa  57.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.47 
 
 		 964 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  30.94 
 
 		 1108 aa  55.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.14 
 
 		 950 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  34.03 
 
 		 850 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  30.93 
 
 		 1141 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0953  sulfatase  29.24 
 
 		 1414 aa  53.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.462358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.16 
 
 		 789 aa  53.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  34.17 
 
 		 965 aa  52.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.89 
 
 		 456 aa  52  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  28.42 
 
 		 613 aa  51.6  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  31.18 
 
 		 978 aa  51.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  30.3 
 
 		 2252 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1010 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  29.13 
 
 		 3802 aa  50.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1960  PA14 domain protein  25.21 
 
 		 204 aa  49.7  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372065  hitchhiker  0.00673603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  29.86 
 
 		 677 aa  49.3  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1504 aa  49.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  28.76 
 
 		 1382 aa  48.9  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6943  hypothetical protein  42.62 
 
 		 602 aa  48.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000267978  normal  0.67649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  25.35 
 
 		 658 aa  48.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  27.55 
 
 		 584 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 1332 aa  47.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  31.58 
 
 		 2215 aa  47.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  31.71 
 
 		 693 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 831 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  25.86 
 
 		 654 aa  47  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  22.98 
 
 		 801 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 1072 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05700  hypothetical protein  35.62 
 
 		 514 aa  47.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0732468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  29.46 
 
 		 631 aa  47.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  27.37 
 
 		 644 aa  46.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1438  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  34.07 
 
 		 639 aa  46.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  28.28 
 
 		 578 aa  45.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  28.92 
 
 		 673 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.63 
 
 		 428 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1549  putative outer membrane protein  21.28 
 
 		 644 aa  45.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0160  hypothetical protein  34.02 
 
 		 600 aa  45.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  28.1 
 
 		 772 aa  45.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>