24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6273 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  1026    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1183  hypothetical protein  53.66 
 
 		 632 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  30 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  50 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  26.36 
 
 		 567 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  45.45 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  30 
 
 		 916 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  45 
 
 		 524 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  41.25 
 
 		 559 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  43.33 
 
 		 642 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2072  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  55.1 
 
 		 1003 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.437854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  50 
 
 		 622 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  40.79 
 
 		 518 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  28.24 
 
 		 451 aa  47.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  28.81 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  39.29 
 
 		 649 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 518 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  42.37 
 
 		 633 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0257  hypothetical protein  44.26 
 
 		 692 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.884266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  25.12 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  30.11 
 
 		 246 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  43.64 
 
 		 983 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.36 
 
 		 582 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  29.31 
 
 		 547 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>