48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2072 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2072  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 1003 aa  2040    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.437854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2071  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  63.26 
 
 		 1003 aa  1295    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.68 
 
 		 998 aa  745    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.3 
 
 		 302 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.91 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.95 
 
 		 307 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  24.25 
 
 		 781 aa  65.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  24.21 
 
 		 1380 aa  59.3  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487463 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  22.86 
 
 		 1380 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  25.68 
 
 		 281 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  35.83 
 
 		 533 aa  55.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  23.45 
 
 		 287 aa  54.7  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  25.74 
 
 		 328 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  44.07 
 
 		 304 aa  51.2  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.32 
 
 		 310 aa  51.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04825  conserved hypothetical protein  23.67 
 
 		 900 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  40.32 
 
 		 334 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.15 
 
 		 407 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2778  hypothetical protein  54.39 
 
 		 611 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4151  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.34 
 
 		 415 aa  48.5  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  50 
 
 		 316 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  55.1 
 
 		 503 aa  48.9  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  48.94 
 
 		 496 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  24.75 
 
 		 328 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3991  hypothetical protein  21.66 
 
 		 635 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697572 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.46 
 
 		 301 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  53.33 
 
 		 495 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2809  hypothetical protein  43.06 
 
 		 836 aa  47.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.46 
 
 		 301 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  32.5 
 
 		 303 aa  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.1 
 
 		 334 aa  47  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25 
 
 		 300 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  33.82 
 
 		 312 aa  47  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  45.45 
 
 		 322 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  36.71 
 
 		 308 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  34.94 
 
 		 308 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  32.04 
 
 		 307 aa  45.8  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  45.61 
 
 		 415 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1560  Parallel beta-helix repeat protein  44.83 
 
 		 832 aa  45.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.672453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  43.18 
 
 		 368 aa  45.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  25.91 
 
 		 323 aa  44.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.64 
 
 		 197 aa  44.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  32.35 
 
 		 371 aa  44.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  23.3 
 
 		 366 aa  44.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  38.64 
 
 		 352 aa  44.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  40.91 
 
 		 357 aa  44.3  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  40.91 
 
 		 363 aa  44.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  38.71 
 
 		 302 aa  44.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>