225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0597 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 
407 aa  820    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  73.41 
 
 
415 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  58.79 
 
 
406 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  49.3 
 
 
371 aa  308  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  45.69 
 
 
350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  47.67 
 
 
312 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  49.28 
 
 
322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  48.99 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  46.99 
 
 
324 aa  279  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  45.89 
 
 
352 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  47.25 
 
 
315 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  46.49 
 
 
313 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  46.49 
 
 
316 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  46.49 
 
 
313 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  46.49 
 
 
313 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  46.49 
 
 
313 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  46.96 
 
 
313 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  46.04 
 
 
312 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  44.57 
 
 
357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  44.74 
 
 
316 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  46.85 
 
 
304 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  45.51 
 
 
332 aa  259  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.95 
 
 
310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  45.48 
 
 
304 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  46.53 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  44.91 
 
 
308 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  44.74 
 
 
306 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  43.81 
 
 
303 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  45.02 
 
 
296 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  44.41 
 
 
303 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  44.44 
 
 
308 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  42.11 
 
 
363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  42.71 
 
 
353 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.17 
 
 
368 aa  242  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  40.66 
 
 
362 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  40.35 
 
 
366 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  40.5 
 
 
372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  42.6 
 
 
302 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  43.54 
 
 
304 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  41.94 
 
 
343 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.82 
 
 
300 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  43.51 
 
 
307 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  43.83 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  43.03 
 
 
304 aa  220  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  40.99 
 
 
328 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  40.38 
 
 
299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  40.68 
 
 
328 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  40 
 
 
302 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  39.44 
 
 
323 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  38.07 
 
 
304 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  35.54 
 
 
533 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  36.73 
 
 
310 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  34.45 
 
 
318 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  38.17 
 
 
281 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  36.29 
 
 
327 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  38.17 
 
 
287 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  31.5 
 
 
338 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  34.07 
 
 
286 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  30.92 
 
 
338 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  34.78 
 
 
340 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  34.32 
 
 
325 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  33.05 
 
 
351 aa  159  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  34.5 
 
 
281 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  34.88 
 
 
314 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  34.08 
 
 
281 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  34.42 
 
 
338 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  31.98 
 
 
338 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  33.24 
 
 
342 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  34.07 
 
 
334 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  55 
 
 
131 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  55 
 
 
131 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  36.55 
 
 
247 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  31.04 
 
 
295 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  28.87 
 
 
545 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  40.91 
 
 
183 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  40.91 
 
 
183 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.54 
 
 
306 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.92 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  27.81 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.91 
 
 
307 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  29.11 
 
 
340 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.29 
 
 
334 aa  113  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.21 
 
 
197 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  27.62 
 
 
339 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  35.15 
 
 
353 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  25.39 
 
 
398 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  32.64 
 
 
477 aa  87.4  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.07 
 
 
581 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  29.53 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.98 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  27.47 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  28.62 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  27.61 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.37 
 
 
579 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  24.75 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  28.23 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.6 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.21 
 
 
300 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.21 
 
 
300 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  27.91 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>