82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1271 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 998 aa  2016    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2072  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.68 
 
 		 1003 aa  745    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.437854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2071  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.75 
 
 		 1003 aa  749    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.36 
 
 		 307 aa  92.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.99 
 
 		 306 aa  88.2  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.56 
 
 		 302 aa  87.8  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  28.37 
 
 		 281 aa  85.9  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  27.76 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  42.42 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.76 
 
 		 334 aa  70.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  21.28 
 
 		 1380 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487463 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04852  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07520)  22.96 
 
 		 934 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  24.58 
 
 		 302 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  23.18 
 
 		 304 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  36.89 
 
 		 533 aa  55.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  35.58 
 
 		 304 aa  55.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  44.44 
 
 		 286 aa  54.7  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  24.88 
 
 		 781 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  34.34 
 
 		 545 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  25.5 
 
 		 299 aa  53.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  41.18 
 
 		 308 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  26.3 
 
 		 303 aa  53.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  46.77 
 
 		 357 aa  52.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  27.21 
 
 		 308 aa  52.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  34.58 
 
 		 312 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  24.34 
 
 		 281 aa  51.6  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  29.91 
 
 		 292 aa  51.6  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.88 
 
 		 310 aa  51.2  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.96 
 
 		 584 aa  51.6  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  31.68 
 
 		 352 aa  50.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  32.35 
 
 		 324 aa  50.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  45.61 
 
 		 470 aa  50.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.68 
 
 		 197 aa  50.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3991  hypothetical protein  21.14 
 
 		 635 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  24.75 
 
 		 366 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.73 
 
 		 406 aa  50.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  31.21 
 
 		 316 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.15 
 
 		 582 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.18 
 
 		 307 aa  49.3  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  45.61 
 
 		 451 aa  49.7  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04825  conserved hypothetical protein  37.1 
 
 		 900 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  26.15 
 
 		 304 aa  49.3  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  23.97 
 
 		 281 aa  49.3  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  24.41 
 
 		 363 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.19 
 
 		 303 aa  49.3  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  36.67 
 
 		 307 aa  49.3  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  45.61 
 
 		 916 aa  48.5  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  24.03 
 
 		 297 aa  48.5  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  35.56 
 
 		 307 aa  48.5  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  24.83 
 
 		 350 aa  48.1  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  45.61 
 
 		 567 aa  47.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  41.27 
 
 		 302 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.73 
 
 		 313 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25 
 
 		 574 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.61 
 
 		 295 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  41.27 
 
 		 306 aa  47  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  27.03 
 
 		 340 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2625  hypothetical protein  46.51 
 
 		 429 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.42 
 
 		 309 aa  47  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  40.3 
 
 		 315 aa  46.6  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  34.38 
 
 		 371 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  43.86 
 
 		 464 aa  46.2  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  23.6 
 
 		 1380 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.32 
 
 		 407 aa  45.8  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.85 
 
 		 415 aa  45.8  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  41.67 
 
 		 304 aa  45.8  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2778  hypothetical protein  33.33 
 
 		 611 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  33.64 
 
 		 312 aa  45.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  46.3 
 
 		 415 aa  45.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  37.93 
 
 		 496 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  47.73 
 
 		 362 aa  45.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.93 
 
 		 300 aa  45.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2809  hypothetical protein  29.63 
 
 		 836 aa  45.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4441  hypothetical protein  30.91 
 
 		 291 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  22.42 
 
 		 304 aa  45.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  35.71 
 
 		 304 aa  44.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  21.4 
 
 		 313 aa  44.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  21.4 
 
 		 313 aa  44.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  28.16 
 
 		 353 aa  44.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  25.17 
 
 		 332 aa  44.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  25.94 
 
 		 314 aa  44.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  23.22 
 
 		 307 aa  44.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>