More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5734 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  100 
 
 
304 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  93.42 
 
 
304 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  78.95 
 
 
303 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  75.75 
 
 
306 aa  491  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  71.71 
 
 
303 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  70.07 
 
 
303 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  65.42 
 
 
302 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  60.2 
 
 
304 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  59.93 
 
 
296 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  59.6 
 
 
310 aa  360  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  58.19 
 
 
299 aa  349  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  59.14 
 
 
312 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  55.15 
 
 
308 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  54.3 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54.21 
 
 
300 aa  338  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  58.86 
 
 
322 aa  335  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  57.67 
 
 
316 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  57.67 
 
 
313 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  57.67 
 
 
313 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  57.67 
 
 
313 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  57.67 
 
 
313 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  58.14 
 
 
316 aa  329  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  56 
 
 
307 aa  328  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  56.38 
 
 
316 aa  328  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  56.33 
 
 
307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  53.85 
 
 
304 aa  326  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  56.29 
 
 
312 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  59.8 
 
 
315 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  56.62 
 
 
313 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  52.35 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  56.43 
 
 
302 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  52.6 
 
 
324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  52.58 
 
 
350 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  49.35 
 
 
310 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  52.49 
 
 
332 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  49.35 
 
 
352 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  51.45 
 
 
353 aa  292  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  50.16 
 
 
357 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  47.22 
 
 
362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  47.08 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  47.45 
 
 
366 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  46.18 
 
 
327 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  46.82 
 
 
363 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  48.06 
 
 
323 aa  262  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.85 
 
 
407 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  45.94 
 
 
286 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  47.46 
 
 
281 aa  258  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  47.35 
 
 
328 aa  255  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  45.74 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  47.35 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  46.74 
 
 
281 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  43.1 
 
 
338 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  44.41 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  42.42 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  46.9 
 
 
281 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  45.83 
 
 
287 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  43.15 
 
 
338 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  41.82 
 
 
371 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  43 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  40.4 
 
 
338 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.9 
 
 
415 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.02 
 
 
406 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  42.01 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  39.6 
 
 
343 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  39.26 
 
 
533 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  43.09 
 
 
247 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  38.26 
 
 
318 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  35.81 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  40.78 
 
 
334 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  37.3 
 
 
340 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  38.25 
 
 
342 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  51.35 
 
 
183 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  51.35 
 
 
183 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  36.22 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  37.09 
 
 
353 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  33.75 
 
 
545 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  66.37 
 
 
131 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  66.37 
 
 
131 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  30.12 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  32.38 
 
 
340 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  29.19 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.38 
 
 
306 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.79 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.4 
 
 
307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  37.31 
 
 
477 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.81 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.62 
 
 
581 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  45.26 
 
 
197 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  31.39 
 
 
296 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  30.68 
 
 
296 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.7 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  34.07 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.77 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.77 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31 
 
 
309 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  41.18 
 
 
123 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  30.34 
 
 
294 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  31.6 
 
 
297 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.11 
 
 
569 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  29.81 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>